73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4282 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  100 
 
 		 444 aa  907    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  55.97 
 
 		 437 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  55.24 
 
 		 442 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  55.24 
 
 		 442 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  56.07 
 
 		 437 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  49.03 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  29.44 
 
 		 891 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  28.09 
 
 		 534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  26.84 
 
 		 602 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  26.12 
 
 		 604 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  28.13 
 
 		 803 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  24.48 
 
 		 1276 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  28.81 
 
 		 801 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  27.94 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  22.53 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  26.69 
 
 		 614 aa  79.7  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  25.88 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  24.86 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  23.48 
 
 		 584 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  24.62 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  23.77 
 
 		 1141 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  22.4 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  22.4 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  22.4 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  24.92 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  25.39 
 
 		 596 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  23.26 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  23.22 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  25.51 
 
 		 562 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  25.79 
 
 		 662 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  23.9 
 
 		 873 aa  60.5  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  23.49 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  23.98 
 
 		 654 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  23.03 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  27.72 
 
 		 510 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  27.72 
 
 		 510 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  27.72 
 
 		 510 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  27.72 
 
 		 510 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  27.72 
 
 		 510 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  27.72 
 
 		 558 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  27.72 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  24.01 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  28.4 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  25.97 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  21.59 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  22.01 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  22.01 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  22.01 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  22.01 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  22.01 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  22.01 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  22.01 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  23.08 
 
 		 564 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  24.32 
 
 		 554 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  20.47 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  26.42 
 
 		 369 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  22.4 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  21.96 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  27.42 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  21.58 
 
 		 596 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  29.05 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  23.61 
 
 		 446 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  22.45 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  22.97 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  24.02 
 
 		 550 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  21.28 
 
 		 597 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 466 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  22.04 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 		 523 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  26.9 
 
 		 307 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3846  hypothetical protein  21.7 
 
 		 314 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1086 aa  43.5  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  25.12 
 
 		 701 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>