93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2001 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  100 
 
 
596 aa  1212    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  38.74 
 
 
584 aa  352  8.999999999999999e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  31.39 
 
 
891 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  33.14 
 
 
801 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  32.14 
 
 
803 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  27.63 
 
 
1276 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  28.88 
 
 
602 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  27.35 
 
 
534 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  29.43 
 
 
604 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  27.11 
 
 
1141 aa  102  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  28.65 
 
 
662 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  25.82 
 
 
460 aa  93.2  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  26.24 
 
 
600 aa  92  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  28.33 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  26.83 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  25.57 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  27.5 
 
 
605 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  31.23 
 
 
340 aa  82  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  26.9 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  28.18 
 
 
444 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  28.26 
 
 
558 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  26.02 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  25.95 
 
 
873 aa  77.8  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  27.13 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  27.85 
 
 
601 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  24.5 
 
 
554 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  28.95 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  28.95 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  27.85 
 
 
601 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  28.95 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  28.95 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  24.28 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  28.95 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  25.44 
 
 
586 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  26.99 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  25.16 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  26.19 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  24.79 
 
 
597 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 
437 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  25.37 
 
 
481 aa  73.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  25.62 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  26.11 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  25.47 
 
 
564 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  25.08 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  27.78 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  31.25 
 
 
1025 aa  70.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  30.06 
 
 
452 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  24.28 
 
 
596 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  26.52 
 
 
550 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  25.52 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  25 
 
 
442 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  25.76 
 
 
654 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  25.39 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  24.74 
 
 
562 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  29.12 
 
 
1086 aa  67  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  24.94 
 
 
500 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  23.34 
 
 
550 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  29.19 
 
 
450 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  22.1 
 
 
450 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  26.81 
 
 
450 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  23.12 
 
 
461 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  26.81 
 
 
450 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  26.81 
 
 
450 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  26.86 
 
 
380 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3404  hypothetical protein  30.77 
 
 
457 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.386077  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  28.23 
 
 
442 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  28.23 
 
 
442 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  28.23 
 
 
442 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  29.64 
 
 
372 aa  60.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  28.23 
 
 
442 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  28.23 
 
 
442 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  28.23 
 
 
442 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  28.23 
 
 
442 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  24.92 
 
 
437 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1027  hypothetical protein  24.22 
 
 
464 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  25.34 
 
 
508 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  25.35 
 
 
780 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0399  hypothetical protein  25.51 
 
 
432 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  34.62 
 
 
864 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  25.38 
 
 
548 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  31.62 
 
 
688 aa  47.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  32.59 
 
 
700 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  26.53 
 
 
649 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.04 
 
 
602 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  22.94 
 
 
368 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
685 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  27.48 
 
 
667 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.5 
 
 
684 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  32.17 
 
 
635 aa  44.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  30.97 
 
 
679 aa  44.3  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6553  hypothetical protein  30.85 
 
 
523 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0933727  hitchhiker  0.00000508986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  20.45 
 
 
1391 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  35.59 
 
 
652 aa  43.5  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>