66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0843 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1144    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  74.11 
 
 
564 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  50.28 
 
 
554 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  30.69 
 
 
1276 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  29.77 
 
 
448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  29.37 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  31.93 
 
 
891 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  30.85 
 
 
602 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  26.99 
 
 
1086 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  31.56 
 
 
604 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  32.39 
 
 
803 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  29.85 
 
 
442 aa  96.7  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  29.85 
 
 
442 aa  96.7  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  29.85 
 
 
442 aa  96.7  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  29.85 
 
 
442 aa  96.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  29.85 
 
 
442 aa  96.7  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  29.85 
 
 
442 aa  97.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  29.85 
 
 
442 aa  97.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  29.85 
 
 
450 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  29.85 
 
 
450 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  30.65 
 
 
450 aa  95.1  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  29.85 
 
 
450 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  25.53 
 
 
326 aa  94.7  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  32.02 
 
 
801 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.18 
 
 
873 aa  91.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  27.73 
 
 
1141 aa  91.3  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  25.06 
 
 
614 aa  88.2  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  25.7 
 
 
605 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  26.77 
 
 
662 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  26.23 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  25 
 
 
596 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 
437 aa  72  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  24.65 
 
 
457 aa  72  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  29.34 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  24.09 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  26.46 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  25.73 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  23.22 
 
 
476 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  22.73 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  25.86 
 
 
584 aa  67  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  26.96 
 
 
415 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  22.38 
 
 
447 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  21.98 
 
 
434 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  24.1 
 
 
436 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  22.32 
 
 
437 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  23.92 
 
 
489 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  24.24 
 
 
425 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.87 
 
 
340 aa  60.8  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  22.65 
 
 
596 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  21.59 
 
 
601 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  24.05 
 
 
442 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  21.59 
 
 
601 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  22.71 
 
 
597 aa  57  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  42.31 
 
 
417 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  24.46 
 
 
442 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  22.82 
 
 
446 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  21.82 
 
 
586 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  23.64 
 
 
444 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  24.62 
 
 
654 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.1 
 
 
512 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  20.49 
 
 
600 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  27.95 
 
 
508 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 
477 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  22.92 
 
 
450 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  22.1 
 
 
461 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  27.07 
 
 
500 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>