70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1593 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  31.85 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  29.19 
 
 		 1276 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  28.89 
 
 		 554 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  23.68 
 
 		 457 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  23.69 
 
 		 489 aa  99.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  26.49 
 
 		 564 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  25.53 
 
 		 562 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  23.86 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  26.38 
 
 		 534 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1086 aa  73.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  24.42 
 
 		 442 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  27.41 
 
 		 415 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  24.42 
 
 		 442 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  24.42 
 
 		 442 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  24.42 
 
 		 442 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  24.42 
 
 		 442 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  24.42 
 
 		 442 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  24.42 
 
 		 442 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  21.47 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  21.47 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  21.47 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  24.09 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  25.32 
 
 		 662 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  26.14 
 
 		 614 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  21.91 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  22.22 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  26.32 
 
 		 605 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  22.65 
 
 		 550 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  24.14 
 
 		 1141 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  22.29 
 
 		 780 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  23.18 
 
 		 873 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  27.03 
 
 		 602 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  21.52 
 
 		 544 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  23.03 
 
 		 1025 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  22.82 
 
 		 340 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  21.24 
 
 		 596 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  26.7 
 
 		 604 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  23.08 
 
 		 891 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  26.53 
 
 		 763 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  21.92 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  21.13 
 
 		 803 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  25.34 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1311  hypothetical protein  21.77 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.549363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  20.69 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  21.33 
 
 		 801 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  26.24 
 
 		 510 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  26.24 
 
 		 510 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  26.24 
 
 		 510 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  26.83 
 
 		 586 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0240  hypothetical protein  24.32 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  20.93 
 
 		 597 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0186  hypothetical protein  24.32 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0500  hypothetical protein  24.32 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  23.84 
 
 		 453 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  24.11 
 
 		 558 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1260  hypothetical protein  24.32 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  21.79 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  25.53 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  25.53 
 
 		 452 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  22.04 
 
 		 444 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  20.94 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  21.79 
 
 		 442 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  23.13 
 
 		 447 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  21.3 
 
 		 434 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  22.86 
 
 		 369 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  23.72 
 
 		 600 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2690  hypothetical protein  21.34 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0820  hypothetical protein  26.28 
 
 		 761 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>