78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3344 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  927    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  86.64 
 
 		 447 aa  778    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  55.38 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  66.57 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  54.42 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  49.67 
 
 		 450 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  54.8 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  53.35 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  49.42 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  50 
 
 		 446 aa  361  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  50.42 
 
 		 600 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  50 
 
 		 596 aa  326  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  48.96 
 
 		 597 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  49.13 
 
 		 601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  48.84 
 
 		 601 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  44.57 
 
 		 586 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  28.11 
 
 		 550 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  29.14 
 
 		 1276 aa  120  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  27.73 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  26.89 
 
 		 550 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  29.71 
 
 		 392 aa  103  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  32.68 
 
 		 380 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  24.3 
 
 		 1025 aa  97.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  25.29 
 
 		 554 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  26.82 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  29.79 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  26.07 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  26.5 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  24.93 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  28.93 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  25.64 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  26.53 
 
 		 605 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  26.76 
 
 		 662 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  24.11 
 
 		 891 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  25.52 
 
 		 596 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  24.09 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  25.65 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  25.65 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  25.65 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  25.65 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  25.65 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  25.65 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  25.65 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  22.63 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  26.9 
 
 		 801 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  24.64 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  28.13 
 
 		 803 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  26.39 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  23.86 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  23.86 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  23.86 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  24.92 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.84 
 
 		 873 aa  60.1  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  23.21 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  23.12 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  22.81 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1086 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  23.6 
 
 		 1141 aa  57.4  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  26.63 
 
 		 604 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  23.82 
 
 		 602 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  28.21 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  27.72 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  26.92 
 
 		 510 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 510 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 510 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  26.15 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  26.15 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  26.15 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  23.43 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  24.17 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  22.89 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  22.19 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  23.84 
 
 		 326 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  22.48 
 
 		 780 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2027  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.18 
 
 		 763 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2297  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.18 
 
 		 797 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  22.98 
 
 		 614 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>