116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3536 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  69.7 
 
 
600 aa  858    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  73.86 
 
 
597 aa  904    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  96.34 
 
 
601 aa  1185    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  72.57 
 
 
596 aa  879    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  100 
 
 
601 aa  1228    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  52.75 
 
 
586 aa  625  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  50.29 
 
 
447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  46.63 
 
 
408 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  48.84 
 
 
453 aa  319  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  46.99 
 
 
425 aa  300  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  46.42 
 
 
436 aa  297  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  44.51 
 
 
434 aa  294  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  42.62 
 
 
476 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  45.3 
 
 
461 aa  294  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  45.3 
 
 
446 aa  293  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  44.66 
 
 
450 aa  290  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  37.4 
 
 
480 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  27.89 
 
 
550 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  40.54 
 
 
354 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  35.19 
 
 
451 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  27.44 
 
 
654 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  26.93 
 
 
550 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.05 
 
 
396 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.25 
 
 
413 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  36.22 
 
 
350 aa  97.8  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  34.6 
 
 
374 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  26.4 
 
 
544 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  35.48 
 
 
334 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  35.6 
 
 
801 aa  94  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  28.88 
 
 
392 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  37.5 
 
 
374 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  36.13 
 
 
803 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.86 
 
 
638 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  26.04 
 
 
1025 aa  90.1  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  33.16 
 
 
338 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  37.82 
 
 
492 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  31.3 
 
 
653 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  36.79 
 
 
375 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  28.88 
 
 
380 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  33.89 
 
 
235 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.88 
 
 
689 aa  84.3  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  34.95 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  28.13 
 
 
372 aa  84  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  26.27 
 
 
1276 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  42.75 
 
 
283 aa  82  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.34 
 
 
597 aa  81.6  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  30.57 
 
 
642 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.88 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  32.82 
 
 
635 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  33.52 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 
688 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  31.11 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  33.7 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  34.39 
 
 
384 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  32.61 
 
 
662 aa  77  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  23.98 
 
 
584 aa  77  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  27.85 
 
 
596 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  36.6 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  28.19 
 
 
891 aa  75.1  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  29.3 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.63 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  26.15 
 
 
369 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.64 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  43.56 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.7 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  30.13 
 
 
656 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  31.97 
 
 
665 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  37.5 
 
 
862 aa  67.4  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  47.5 
 
 
400 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  29.39 
 
 
421 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.73 
 
 
398 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  24.54 
 
 
605 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.58 
 
 
722 aa  64.3  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  26.57 
 
 
442 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  23.32 
 
 
554 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  31.67 
 
 
457 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  26.25 
 
 
442 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  26.25 
 
 
442 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  31.25 
 
 
362 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  26.25 
 
 
442 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  26.25 
 
 
442 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  26.25 
 
 
442 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  26.25 
 
 
442 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  26.25 
 
 
442 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  24.01 
 
 
534 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  23.12 
 
 
1141 aa  61.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  25.44 
 
 
450 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  25.44 
 
 
450 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  25.98 
 
 
442 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  25.44 
 
 
450 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  32.06 
 
 
340 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  21.59 
 
 
562 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  24.62 
 
 
415 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.95 
 
 
370 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.33 
 
 
500 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  25.78 
 
 
602 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 
437 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  26.49 
 
 
472 aa  53.9  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.06 
 
 
397 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  23.62 
 
 
604 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>