83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3384 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  845    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  47.53 
 
 
476 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  51.3 
 
 
434 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  44.01 
 
 
447 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  46.95 
 
 
461 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  45.09 
 
 
450 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  49.42 
 
 
453 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  52.94 
 
 
586 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  45 
 
 
425 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  44.39 
 
 
436 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  41.23 
 
 
446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  50.14 
 
 
600 aa  336  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  47.47 
 
 
601 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  46.63 
 
 
601 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  48.17 
 
 
596 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  48.18 
 
 
597 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  28.48 
 
 
544 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  27.99 
 
 
550 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  27.6 
 
 
1025 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  26.72 
 
 
550 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  27.73 
 
 
1276 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  26.86 
 
 
340 aa  89.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  26.11 
 
 
372 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  26.9 
 
 
584 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.32 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  26.52 
 
 
398 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  24.38 
 
 
369 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  25.57 
 
 
596 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  25.15 
 
 
605 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  25.17 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  24.68 
 
 
554 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  25.93 
 
 
564 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  26.52 
 
 
891 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  25.31 
 
 
614 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  25.6 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  24.84 
 
 
662 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  26.23 
 
 
562 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  25.6 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  25.65 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  23.75 
 
 
534 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  25.42 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  24.65 
 
 
448 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  23.22 
 
 
444 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  22.02 
 
 
1141 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  24.15 
 
 
558 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  29.09 
 
 
468 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  25.36 
 
 
803 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  24.05 
 
 
442 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  24.05 
 
 
442 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  24.05 
 
 
442 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  24.05 
 
 
442 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  24.05 
 
 
442 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  22.71 
 
 
444 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  20.72 
 
 
450 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  20.72 
 
 
450 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  20.72 
 
 
450 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  24.05 
 
 
442 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  24.05 
 
 
442 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  26.98 
 
 
873 aa  56.6  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  23.37 
 
 
510 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  26.95 
 
 
452 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  23.37 
 
 
510 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  26.95 
 
 
510 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  23.36 
 
 
489 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  26.95 
 
 
510 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  26.95 
 
 
510 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  24.26 
 
 
780 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  22.43 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  24.79 
 
 
801 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  23.53 
 
 
472 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  29.23 
 
 
309 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  28.23 
 
 
491 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.73 
 
 
669 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  25.42 
 
 
503 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22 
 
 
680 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3404  hypothetical protein  26.11 
 
 
457 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.386077  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  20.94 
 
 
326 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
672 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 
678 aa  43.9  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  22.95 
 
 
602 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1426  hypothetical protein  26.92 
 
 
431 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0176369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
672 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>