102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3256 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  100 
 
 
1025 aa  2030    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  53.47 
 
 
550 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  55.72 
 
 
550 aa  557  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  40 
 
 
544 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  41.08 
 
 
497 aa  224  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2653  O-antigen polymerase  39.26 
 
 
499 aa  211  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  29.62 
 
 
392 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  27.6 
 
 
408 aa  127  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  35.48 
 
 
502 aa  121  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  27.96 
 
 
446 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  29.2 
 
 
436 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  29.95 
 
 
380 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  29.12 
 
 
425 aa  109  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  26.87 
 
 
586 aa  108  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  25.42 
 
 
447 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  27.33 
 
 
340 aa  102  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  27 
 
 
372 aa  101  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  24.94 
 
 
600 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  24.3 
 
 
453 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  24.94 
 
 
369 aa  96.3  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  25.99 
 
 
596 aa  94.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  24.53 
 
 
461 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  24.74 
 
 
1276 aa  93.2  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  26.04 
 
 
601 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  25.56 
 
 
597 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  24 
 
 
450 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  26.04 
 
 
601 aa  89.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.67 
 
 
415 aa  89.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  27.38 
 
 
434 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  24.37 
 
 
476 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  34.13 
 
 
801 aa  81.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  31.75 
 
 
803 aa  78.2  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  32.58 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  24.91 
 
 
662 aa  76.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  26.21 
 
 
891 aa  74.7  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  31.25 
 
 
596 aa  70.5  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  25.94 
 
 
602 aa  68.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  27.46 
 
 
604 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  23.71 
 
 
584 aa  65.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  23.6 
 
 
510 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  24.01 
 
 
534 aa  65.1  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  25.16 
 
 
510 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  25.16 
 
 
510 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  24.53 
 
 
510 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  25.66 
 
 
452 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  24.53 
 
 
510 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  31.1 
 
 
474 aa  62  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  23.68 
 
 
558 aa  62  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2378  O-antigen polymerase  29.42 
 
 
700 aa  61.6  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.868657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  27.95 
 
 
654 aa  61.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  24.75 
 
 
398 aa  59.3  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  28.69 
 
 
540 aa  58.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  27.34 
 
 
461 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.68 
 
 
457 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.68 
 
 
457 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  26.67 
 
 
475 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  26.01 
 
 
501 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 
684 aa  57  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  27.78 
 
 
471 aa  56.6  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 
685 aa  56.2  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  28.63 
 
 
461 aa  55.1  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  36.11 
 
 
442 aa  53.5  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  36.11 
 
 
442 aa  53.5  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  36.11 
 
 
442 aa  53.5  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  36.11 
 
 
442 aa  53.5  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  36.11 
 
 
442 aa  53.5  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  36.11 
 
 
442 aa  53.5  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  36.11 
 
 
442 aa  53.5  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  23.03 
 
 
326 aa  53.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  25.61 
 
 
605 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 
437 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  36.11 
 
 
450 aa  52.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  29.36 
 
 
437 aa  52.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  25.26 
 
 
468 aa  52.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  27.02 
 
 
454 aa  51.6  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  30.06 
 
 
873 aa  51.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  23.83 
 
 
614 aa  48.9  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  23.69 
 
 
472 aa  48.9  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  46.27 
 
 
894 aa  48.9  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  32.65 
 
 
457 aa  48.5  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  28.99 
 
 
438 aa  48.5  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  22.78 
 
 
481 aa  48.5  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  23.91 
 
 
450 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  26.32 
 
 
442 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  23.91 
 
 
450 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  23.91 
 
 
450 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  28.77 
 
 
393 aa  47.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.96 
 
 
512 aa  47.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  22.6 
 
 
780 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  26.82 
 
 
443 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  26.32 
 
 
442 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  21.48 
 
 
781 aa  47.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  25.56 
 
 
470 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  20.07 
 
 
1141 aa  47  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  25.11 
 
 
579 aa  45.8  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  32.69 
 
 
544 aa  45.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  26.11 
 
 
489 aa  45.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  28.29 
 
 
464 aa  45.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  24.79 
 
 
496 aa  45.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  35.05 
 
 
430 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>