87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3764 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1235    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  51.37 
 
 		 614 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  30.94 
 
 		 1276 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  28.69 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  27.76 
 
 		 602 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  27.95 
 
 		 604 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  24.85 
 
 		 891 aa  94.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  28.71 
 
 		 873 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  28.47 
 
 		 803 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  26.35 
 
 		 1141 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  29.25 
 
 		 801 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  29.58 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  27.35 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  25.7 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  24.12 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  27.5 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  25.38 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  25.95 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  26.48 
 
 		 564 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  25.15 
 
 		 600 aa  78.2  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  23.89 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1086 aa  77.8  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  25.95 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  25.88 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  22.65 
 
 		 596 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  22.42 
 
 		 597 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  26.53 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  24 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  25.66 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  23.47 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  24.53 
 
 		 586 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  27.4 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  25 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  24.54 
 
 		 601 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  24.54 
 
 		 601 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  23.26 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  22.43 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  25.21 
 
 		 584 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  22.99 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  30.18 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  24.86 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  27.68 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  22.7 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  30.43 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  25.62 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  24.9 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  25 
 
 		 500 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  29.14 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  22.37 
 
 		 448 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  24.01 
 
 		 654 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  26.78 
 
 		 442 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  26.78 
 
 		 442 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  26.78 
 
 		 442 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  26.78 
 
 		 442 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  26.78 
 
 		 442 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  26.32 
 
 		 326 aa  55.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  26.78 
 
 		 442 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  26.78 
 
 		 442 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  24.26 
 
 		 550 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  25.61 
 
 		 1025 aa  53.9  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  23.31 
 
 		 481 aa  53.9  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  23.62 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3404  hypothetical protein  29.31 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.386077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  26.63 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  30.43 
 
 		 1018 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  27.22 
 
 		 309 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  27.97 
 
 		 380 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  24.33 
 
 		 450 aa  51.2  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  32.06 
 
 		 679 aa  50.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  23.83 
 
 		 369 aa  50.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  25.28 
 
 		 491 aa  50.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  27.44 
 
 		 450 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  27.44 
 
 		 450 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  27.44 
 
 		 450 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0399  hypothetical protein  25.95 
 
 		 432 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  21.12 
 
 		 780 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 		 437 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  26.97 
 
 		 477 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  25 
 
 		 727 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  23.29 
 
 		 482 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  26.09 
 
 		 864 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  29.21 
 
 		 576 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  29.32 
 
 		 561 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 		 680 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  24.03 
 
 		 495 aa  44.3  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  26.9 
 
 		 550 aa  43.9  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  25.49 
 
 		 489 aa  43.5  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>