117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3713 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  69.87 
 
 
600 aa  861    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  74.03 
 
 
597 aa  909    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  100 
 
 
601 aa  1227    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  72.9 
 
 
596 aa  893    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  96.34 
 
 
601 aa  1185    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  53.77 
 
 
586 aa  635    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  50.29 
 
 
447 aa  329  8e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  47.47 
 
 
408 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  49.13 
 
 
453 aa  320  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  47.28 
 
 
425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  46.7 
 
 
436 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  46.01 
 
 
461 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  42.9 
 
 
476 aa  298  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  44.8 
 
 
434 aa  297  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  45.58 
 
 
446 aa  294  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  45.38 
 
 
450 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  37.8 
 
 
480 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  27.89 
 
 
550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  36.91 
 
 
354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  35.34 
 
 
451 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  35.74 
 
 
374 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  27.27 
 
 
550 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  27.47 
 
 
544 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  27.21 
 
 
654 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  36.73 
 
 
350 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.04 
 
 
396 aa  101  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  36.08 
 
 
801 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.13 
 
 
413 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.78 
 
 
638 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  38.5 
 
 
374 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  36.6 
 
 
803 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  36.9 
 
 
334 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  36.27 
 
 
338 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  30.21 
 
 
392 aa  94.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  26.04 
 
 
1025 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  38.34 
 
 
492 aa  90.9  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  37.11 
 
 
375 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  30.43 
 
 
653 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.03 
 
 
689 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  28.88 
 
 
380 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  33.05 
 
 
235 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  34.8 
 
 
345 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  31.44 
 
 
642 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  26.42 
 
 
1276 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  28.13 
 
 
372 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  30.94 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.12 
 
 
597 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  33.33 
 
 
635 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.88 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  32.98 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  35.96 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  31.67 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.92 
 
 
688 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  33.7 
 
 
662 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  29.73 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  23.98 
 
 
584 aa  77.4  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  34.78 
 
 
376 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  27.85 
 
 
596 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  36.6 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  26.15 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.63 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.42 
 
 
376 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  28.52 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  27.85 
 
 
891 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  31.49 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  44.55 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.65 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  32.82 
 
 
665 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.85 
 
 
862 aa  67.8  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.16 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  24.54 
 
 
605 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  29.71 
 
 
656 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  23.62 
 
 
554 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.58 
 
 
722 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  31.67 
 
 
457 aa  63.9  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  32.47 
 
 
362 aa  63.9  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  26.57 
 
 
442 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  26.25 
 
 
442 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  26.25 
 
 
442 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  26.25 
 
 
442 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  26.25 
 
 
442 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  26.25 
 
 
442 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  26.25 
 
 
442 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  26.25 
 
 
442 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  22.83 
 
 
1141 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  21.59 
 
 
562 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  25.98 
 
 
442 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  31.73 
 
 
340 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  23.73 
 
 
534 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  24.62 
 
 
415 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 
370 aa  57.4  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  25.3 
 
 
450 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  25.3 
 
 
450 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  25.3 
 
 
450 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.25 
 
 
500 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 
437 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  26.49 
 
 
472 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3404  hypothetical protein  25.63 
 
 
457 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.386077  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  26.13 
 
 
602 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.95 
 
 
397 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>