66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1159 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  89.79 
 
 
656 aa  1171    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  100 
 
 
665 aa  1323    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  37.67 
 
 
459 aa  231  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  43.66 
 
 
354 aa  130  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  30.21 
 
 
451 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.85 
 
 
689 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.33 
 
 
688 aa  120  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  45.05 
 
 
350 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.53 
 
 
413 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.12 
 
 
638 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.95 
 
 
396 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  43.78 
 
 
662 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  39.66 
 
 
374 aa  107  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.5 
 
 
455 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  41.11 
 
 
376 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.32 
 
 
374 aa  104  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  37.09 
 
 
384 aa  104  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.3 
 
 
597 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  40.29 
 
 
374 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  41.62 
 
 
376 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  39.55 
 
 
375 aa  100  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  44.23 
 
 
306 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.69 
 
 
376 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  42.58 
 
 
283 aa  94.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1280  hypothetical protein  27.52 
 
 
540 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.66 
 
 
398 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.03 
 
 
722 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.44 
 
 
397 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  33.03 
 
 
654 aa  89  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  33.18 
 
 
653 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  38.1 
 
 
801 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  36 
 
 
480 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  34.98 
 
 
492 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0527  hypothetical protein  27.41 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0894416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  37.97 
 
 
803 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  35.78 
 
 
457 aa  84  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  33.74 
 
 
340 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  34.88 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  34.02 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  33.98 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  30.06 
 
 
400 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.65 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  34.45 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  34.1 
 
 
642 aa  77.4  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  34.73 
 
 
597 aa  77.4  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3530  hypothetical protein  27.41 
 
 
327 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  32.51 
 
 
235 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  27.71 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  33.48 
 
 
600 aa  74.7  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  32.28 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  30.95 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  32.82 
 
 
601 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  35.83 
 
 
596 aa  67.8  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  32.23 
 
 
635 aa  67.8  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  31.97 
 
 
601 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1411  hypothetical protein  34.81 
 
 
886 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.57 
 
 
453 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.93 
 
 
500 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1847  hypothetical protein  30.24 
 
 
416 aa  63.9  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  32.39 
 
 
586 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  40 
 
 
281 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3503  hypothetical protein  45 
 
 
131 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.71 
 
 
862 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  33.33 
 
 
804 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1704  hypothetical protein  33.33 
 
 
886 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.298194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1313  hypothetical protein  24.51 
 
 
321 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.990432  normal  0.510849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>