275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3490 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
397 aa  801    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  79.55 
 
 
398 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.39 
 
 
376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.33 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.86 
 
 
374 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.14 
 
 
396 aa  236  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.73 
 
 
413 aa  229  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 
257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.41 
 
 
155 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.22 
 
 
171 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.98 
 
 
206 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45 
 
 
177 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.15 
 
 
171 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.49 
 
 
407 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.46 
 
 
481 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  34.44 
 
 
665 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  34.76 
 
 
374 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  31.54 
 
 
374 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.12 
 
 
170 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  33.71 
 
 
656 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  34.3 
 
 
459 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  30.49 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  36.22 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  35.67 
 
 
662 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  39.23 
 
 
507 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  34.91 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  35.48 
 
 
480 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  39.2 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  36.17 
 
 
531 aa  82  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.01 
 
 
689 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.9 
 
 
688 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  31.05 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  36.61 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.56 
 
 
866 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  33.51 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.48 
 
 
605 aa  72  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.51 
 
 
628 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  38.06 
 
 
574 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  29.58 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.45 
 
 
638 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.28 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  32.04 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  30.59 
 
 
597 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  34.16 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  31.96 
 
 
600 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  31.68 
 
 
596 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  31.52 
 
 
334 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.18 
 
 
597 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  30.59 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  29.41 
 
 
586 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  30.28 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  31.21 
 
 
492 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.07 
 
 
292 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  31.19 
 
 
804 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.43 
 
 
257 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.01 
 
 
309 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  35.2 
 
 
521 aa  60.8  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  31.52 
 
 
601 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  32.53 
 
 
601 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.65 
 
 
215 aa  60.1  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  30 
 
 
722 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  39.13 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.59 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1745  hypothetical protein  40.18 
 
 
187 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0385777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  30.1 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  30.99 
 
 
803 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  33.9 
 
 
349 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  29.82 
 
 
801 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.31 
 
 
142 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.71 
 
 
289 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.23 
 
 
256 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2089  hypothetical protein  40.18 
 
 
253 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  27.59 
 
 
345 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.85 
 
 
278 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.3 
 
 
204 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.12 
 
 
278 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1160  hypothetical protein  35.85 
 
 
350 aa  56.6  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.74704  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
250 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.03 
 
 
194 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.03 
 
 
194 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  30 
 
 
375 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5256  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.91 
 
 
524 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210473  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.5 
 
 
411 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.88 
 
 
112 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  32.31 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.43 
 
 
201 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.98 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35 
 
 
139 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.06 
 
 
541 aa  55.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.914763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7242  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.13 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0270028  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.3 
 
 
273 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  29.68 
 
 
568 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  35.66 
 
 
281 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2566  enhanced entry protein EnhA  31.25 
 
 
235 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.08 
 
 
300 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1222  enhanced entry protein  26.85 
 
 
253 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0332065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  26.11 
 
 
635 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  31.45 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1268  enhanced entry protein EnhA  26.85 
 
 
252 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.353847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  30.43 
 
 
415 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>