67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0383 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  100 
 
 
656 aa  1306    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  89.79 
 
 
665 aa  1155    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  37.08 
 
 
459 aa  233  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  45.37 
 
 
354 aa  130  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.95 
 
 
689 aa  123  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  29.34 
 
 
451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.56 
 
 
688 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.67 
 
 
413 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.56 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  44.57 
 
 
350 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  39.83 
 
 
374 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.66 
 
 
638 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  38.36 
 
 
374 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  43.78 
 
 
662 aa  111  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.46 
 
 
455 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.31 
 
 
374 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  40.33 
 
 
376 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  35.24 
 
 
384 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  43.87 
 
 
283 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.76 
 
 
597 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  44.23 
 
 
306 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  39.77 
 
 
376 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  38.89 
 
 
375 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  34.47 
 
 
340 aa  94.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  35.45 
 
 
480 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.35 
 
 
376 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  33.33 
 
 
654 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.67 
 
 
398 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.14 
 
 
722 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  37.97 
 
 
803 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  36.36 
 
 
457 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  37.97 
 
 
801 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  34.98 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  31.53 
 
 
653 aa  84.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1280  hypothetical protein  27.25 
 
 
540 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  33.61 
 
 
597 aa  80.5  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.29 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.71 
 
 
397 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  38.32 
 
 
362 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  34.92 
 
 
338 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0527  hypothetical protein  29.19 
 
 
540 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0894416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  32.32 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  30.06 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  34.45 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  34.09 
 
 
642 aa  77.4  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3530  hypothetical protein  27.8 
 
 
327 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  27.39 
 
 
334 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  32.74 
 
 
586 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  30.46 
 
 
235 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  29.17 
 
 
415 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  32.56 
 
 
600 aa  70.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  33.33 
 
 
596 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  31.7 
 
 
345 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  30.13 
 
 
601 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1411  hypothetical protein  32.42 
 
 
886 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  30.91 
 
 
635 aa  67.4  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1847  hypothetical protein  30.24 
 
 
416 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  29.71 
 
 
601 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.82 
 
 
453 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.35 
 
 
500 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  40 
 
 
281 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1704  hypothetical protein  31.37 
 
 
886 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.298194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.19 
 
 
862 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  30.66 
 
 
804 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3503  hypothetical protein  45 
 
 
131 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1313  hypothetical protein  24.84 
 
 
321 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.990432  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1640  hypothetical protein  23.1 
 
 
313 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.223607  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>