67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0340 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  1010    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  50.95 
 
 
455 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  46.96 
 
 
654 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.6 
 
 
689 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  54.26 
 
 
803 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.47 
 
 
688 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.43 
 
 
722 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  39.72 
 
 
384 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.13 
 
 
597 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  52.66 
 
 
801 aa  181  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  48.5 
 
 
338 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  40.93 
 
 
375 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  52.49 
 
 
345 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.65 
 
 
638 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  41.18 
 
 
415 aa  173  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  48 
 
 
340 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  44.34 
 
 
347 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  46.86 
 
 
457 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  44.75 
 
 
451 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  44.14 
 
 
653 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  49.72 
 
 
334 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  45.81 
 
 
421 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  40.17 
 
 
235 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  46.63 
 
 
635 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  42.86 
 
 
400 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  44.5 
 
 
374 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  41.41 
 
 
642 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  43.89 
 
 
374 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  41.24 
 
 
662 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  35.74 
 
 
350 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  36.97 
 
 
586 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  38.53 
 
 
376 aa  120  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  33.77 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  37.85 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  55 
 
 
281 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  38.01 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.9 
 
 
413 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.33 
 
 
396 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  35.89 
 
 
480 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  38.53 
 
 
597 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  38.53 
 
 
596 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  37.33 
 
 
601 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1411  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  36.61 
 
 
601 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  30.09 
 
 
459 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  33.76 
 
 
665 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  34.33 
 
 
656 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  39.11 
 
 
306 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  34.65 
 
 
600 aa  87  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  36.31 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.22 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3451  hypothetical protein  77.55 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.69 
 
 
862 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.39 
 
 
376 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  30.72 
 
 
804 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.35 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  34 
 
 
453 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.13 
 
 
370 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.14 
 
 
500 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3503  hypothetical protein  37.18 
 
 
131 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  32 
 
 
792 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.33 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  37.89 
 
 
891 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  34.69 
 
 
760 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  28.93 
 
 
710 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  30.59 
 
 
709 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>