274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2153 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
398 aa  800    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  78.84 
 
 
397 aa  591  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.59 
 
 
376 aa  325  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.1 
 
 
370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.11 
 
 
374 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.01 
 
 
396 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.06 
 
 
413 aa  235  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.19 
 
 
257 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.37 
 
 
171 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.3 
 
 
155 aa  106  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  33.72 
 
 
374 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.4 
 
 
407 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.96 
 
 
171 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.3 
 
 
206 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  34.73 
 
 
374 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.58 
 
 
177 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  35.96 
 
 
354 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  35.23 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  34.47 
 
 
459 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  32.93 
 
 
665 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.86 
 
 
481 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  33.01 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.55 
 
 
689 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  32.66 
 
 
656 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  38.6 
 
 
662 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.17 
 
 
170 aa  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.61 
 
 
688 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  35.48 
 
 
480 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  38.69 
 
 
531 aa  86.3  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  39.23 
 
 
507 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  30.58 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  31.28 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  30.99 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  32.33 
 
 
600 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  30.6 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
597 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  40 
 
 
283 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.95 
 
 
638 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.3 
 
 
866 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  30.58 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.29 
 
 
605 aa  72.4  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  31.25 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.51 
 
 
628 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  31.25 
 
 
586 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.1 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  35.82 
 
 
574 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  38.01 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  30.92 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  32.65 
 
 
601 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  32.05 
 
 
492 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  34.59 
 
 
306 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  34.32 
 
 
596 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  32.73 
 
 
601 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  32.56 
 
 
597 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.89 
 
 
292 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.37 
 
 
722 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  27.65 
 
 
653 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  31.38 
 
 
415 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  30.77 
 
 
384 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
194 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
194 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  34.53 
 
 
536 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  30.77 
 
 
375 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  31.18 
 
 
804 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  29.35 
 
 
801 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  38.18 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  34.96 
 
 
281 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.69 
 
 
204 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.82 
 
 
273 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.29 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  29.89 
 
 
803 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  30.64 
 
 
457 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  33.09 
 
 
519 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.17 
 
 
215 aa  57.8  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5256  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.47 
 
 
524 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210473  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.79 
 
 
309 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  34.65 
 
 
496 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.3 
 
 
500 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.84 
 
 
250 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.83 
 
 
411 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.19 
 
 
325 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148197  hitchhiker  0.0000281321 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1745  hypothetical protein  39.29 
 
 
187 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0385777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7242  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.07 
 
 
445 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0270028  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  33.9 
 
 
349 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  33.6 
 
 
521 aa  56.2  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2320  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.14 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00187329  hitchhiker  0.0000416474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  33.33 
 
 
503 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.07 
 
 
142 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.75 
 
 
289 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1922  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.88 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395353  unclonable  2.80385e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35 
 
 
139 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2089  hypothetical protein  39.29 
 
 
253 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  31.86 
 
 
654 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.23 
 
 
541 aa  55.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.914763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.07 
 
 
292 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.63 
 
 
217 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  31.45 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  28.05 
 
 
642 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  27.19 
 
 
635 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1762  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.51 
 
 
325 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000230902  hitchhiker  0.000000000000707546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>