58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4187 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
407 aa  840    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.07 
 
 
628 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.58 
 
 
257 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.07 
 
 
170 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.46 
 
 
206 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.92 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.3 
 
 
171 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.9 
 
 
177 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.4 
 
 
398 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.4 
 
 
171 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.3 
 
 
396 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.49 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.64 
 
 
413 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.88 
 
 
370 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.03 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  35.54 
 
 
507 aa  86.7  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.47 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.92 
 
 
481 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.82 
 
 
866 aa  73.2  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  35.53 
 
 
574 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
168 aa  59.7  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.95 
 
 
190 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.04 
 
 
139 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  29.2 
 
 
330 aa  53.5  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.47 
 
 
142 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.09 
 
 
257 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.71 
 
 
605 aa  51.6  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.42 
 
 
142 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  27.91 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2863  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.32 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.772314  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  27.2 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.45 
 
 
300 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  28.57 
 
 
361 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  28.7 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.71 
 
 
415 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28 
 
 
184 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.7 
 
 
247 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  28.21 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  30.48 
 
 
347 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5369  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846692  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.48 
 
 
498 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  30.48 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
292 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310092  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  27.68 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2824  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5680  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5330  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104787  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0726  hypothetical protein  29.08 
 
 
210 aa  44.3  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.27 
 
 
492 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5983  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.09 
 
 
396 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.538368  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.43 
 
 
236 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.78 
 
 
250 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  23.53 
 
 
205 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27 
 
 
209 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.91 
 
 
235 aa  43.1  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1366  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.31 
 
 
281 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2045  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.44 
 
 
211 aa  43.1  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>