72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1366 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1366  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 281 aa  584  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  88.04 
 
 		 281 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.444945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1402  hypothetical protein  64.21 
 
 		 276 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0546  hypothetical protein  58.67 
 
 		 266 aa  332  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.9 
 
 		 290 aa  291  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3161  hypothetical protein  52.17 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.78 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.97 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.07 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.85 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.08 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000908265  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.38 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.31 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.85 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000029403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.43 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.8 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.82 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1268  enhanced entry protein EnhA  30.81 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.353847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1222  enhanced entry protein  30.81 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0332065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.03 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2566  enhanced entry protein EnhA  26.43 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2694  enhanced entry protein EnhA  25.99 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  30.17 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  30.17 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.82 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2040  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.39 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  31.06 
 
 		 361 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  29.82 
 
 		 408 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  31.07 
 
 		 537 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  27.68 
 
 		 519 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  30.69 
 
 		 520 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  29.7 
 
 		 568 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  27.5 
 
 		 520 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  30.69 
 
 		 493 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  31.07 
 
 		 503 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  32.73 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  29.7 
 
 		 575 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  31.53 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  31.53 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  29.7 
 
 		 588 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1236  enhanced entry protein  27.6 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1285  enhanced entry protein EnhA  27.6 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00169403  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2050  enhanced entry protein  29.02 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.752408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0142  putative enhanced entry protein EnhA  29.02 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.387138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  26.05 
 
 		 496 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.82 
 
 		 171 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  25.41 
 
 		 536 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.43 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  28.71 
 
 		 411 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  25 
 
 		 503 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  30.1 
 
 		 344 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.94 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.03 
 
 		 205 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  27.68 
 
 		 419 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  28.09 
 
 		 455 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2219  hypothetical protein  23.21 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0511486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  27.93 
 
 		 349 aa  45.8  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.8 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363302  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  26.55 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3103  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.3 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.31 
 
 		 407 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4260  hypothetical protein  27.35 
 
 		 186 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3894  ErfK/SrfK protein  28.21 
 
 		 186 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000648074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  28.21 
 
 		 186 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0975  hypothetical protein  27.35 
 
 		 186 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0886923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4170  hypothetical protein  28.68 
 
 		 186 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  28.21 
 
 		 186 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3901  erfK/srfK protein  28.21 
 
 		 186 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00361052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4055  hypothetical protein  28.21 
 
 		 186 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4372  hypothetical protein  28.21 
 
 		 186 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>