98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2501 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1180    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  66.32 
 
 		 575 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  52.54 
 
 		 537 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  44.97 
 
 		 568 aa  392  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  43.29 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  57.96 
 
 		 493 aa  265  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  55.23 
 
 		 520 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  46.67 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  48.98 
 
 		 519 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  50.37 
 
 		 503 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  54.23 
 
 		 496 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  45.24 
 
 		 330 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  50.35 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  50.79 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  51.91 
 
 		 536 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  50.33 
 
 		 418 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  43.98 
 
 		 411 aa  148  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  44.97 
 
 		 354 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  44.97 
 
 		 347 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  38.72 
 
 		 361 aa  146  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  47.02 
 
 		 408 aa  146  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  44.85 
 
 		 344 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  43.18 
 
 		 349 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.13 
 
 		 230 aa  87.4  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.56 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.61 
 
 		 250 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.99 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0420468 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.13 
 
 		 247 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.18 
 
 		 292 aa  72  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.41 
 
 		 257 aa  72  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.65 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.19 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.61 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.51 
 
 		 142 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.62 
 
 		 219 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.88 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.71 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.85 
 
 		 183 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 		 270 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.36 
 
 		 177 aa  56.2  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.29 
 
 		 211 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.56 
 
 		 309 aa  55.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.29 
 
 		 253 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.19 
 
 		 278 aa  54.3  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0546  hypothetical protein  26.32 
 
 		 266 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.04 
 
 		 209 aa  53.9  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.36 
 
 		 303 aa  53.9  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.26 
 
 		 214 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0095  hypothetical protein  28.06 
 
 		 143 aa  53.9  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.29 
 
 		 251 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.43 
 
 		 171 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.32 
 
 		 269 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.84 
 
 		 214 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.08 
 
 		 144 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.63 
 
 		 184 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.32 
 
 		 209 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1402  hypothetical protein  30.61 
 
 		 276 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  36.94 
 
 		 248 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  36.94 
 
 		 248 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.8 
 
 		 294 aa  51.6  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.63 
 
 		 278 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000908265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.18 
 
 		 260 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  37.18 
 
 		 264 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1366  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.7 
 
 		 281 aa  50.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.15 
 
 		 386 aa  50.4  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.7 
 
 		 291 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000029403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.22 
 
 		 386 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.68 
 
 		 292 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.12 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.77 
 
 		 270 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.87 
 
 		 278 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.79 
 
 		 190 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.69 
 
 		 139 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.7 
 
 		 281 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.444945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.14 
 
 		 243 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.98 
 
 		 217 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.63 
 
 		 295 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.15 
 
 		 376 aa  47.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0142  putative enhanced entry protein EnhA  30.88 
 
 		 232 aa  47.8  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.387138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2242  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.41 
 
 		 427 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40808  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.14 
 
 		 216 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.17 
 
 		 223 aa  47.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.93 
 
 		 212 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2050  enhanced entry protein  30.88 
 
 		 249 aa  47  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.752408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.87 
 
 		 413 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.34 
 
 		 270 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 		 257 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1236  enhanced entry protein  33.94 
 
 		 245 aa  45.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2100  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.93 
 
 		 427 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0449665  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.55 
 
 		 290 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1285  enhanced entry protein EnhA  33.94 
 
 		 245 aa  45.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00169403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3161  hypothetical protein  27.55 
 
 		 286 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.72 
 
 		 268 aa  44.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.23 
 
 		 142 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.72 
 
 		 370 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.22 
 
 		 326 aa  44.3  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.81 
 
 		 168 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.4 
 
 		 396 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>