48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1098 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
290 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3161  hypothetical protein  93.04 
 
 
286 aa  535  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0546  hypothetical protein  63.22 
 
 
266 aa  348  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1402  hypothetical protein  55.43 
 
 
276 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1366  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.9 
 
 
281 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.77 
 
 
281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.444945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.57 
 
 
292 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.66 
 
 
309 aa  198  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.62 
 
 
303 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.33 
 
 
278 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.46 
 
 
278 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.85 
 
 
295 aa  188  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.62 
 
 
278 aa  188  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000908265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.13 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.59 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.89 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.21 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  30.09 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  29.65 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.37 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1268  enhanced entry protein EnhA  32.07 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.353847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1222  enhanced entry protein  32.07 
 
 
253 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0332065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.56 
 
 
291 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000029403  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2694  enhanced entry protein EnhA  25.6 
 
 
240 aa  62.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2040  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.81 
 
 
321 aa  62.4  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2566  enhanced entry protein EnhA  25.98 
 
 
235 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2050  enhanced entry protein  28.65 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.752408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0142  putative enhanced entry protein EnhA  28.65 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.387138  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1236  enhanced entry protein  26.74 
 
 
245 aa  49.7  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  28.71 
 
 
575 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1285  enhanced entry protein EnhA  26.74 
 
 
245 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00169403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  27.73 
 
 
537 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  29.7 
 
 
520 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  27.72 
 
 
568 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  29.13 
 
 
503 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  26.98 
 
 
349 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  26.98 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  25.74 
 
 
588 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2219  hypothetical protein  23.23 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0511486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  25.44 
 
 
408 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  25.89 
 
 
419 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  27.72 
 
 
493 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  28.04 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  26.26 
 
 
347 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  27.45 
 
 
520 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.67 
 
 
370 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  29.46 
 
 
354 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>