64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1402 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1366  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64.21 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  63.24 
 
 		 281 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.444945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0546  hypothetical protein  60.52 
 
 		 266 aa  343  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.43 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3161  hypothetical protein  54.41 
 
 		 286 aa  298  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.49 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.69 
 
 		 278 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.42 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.29 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.5 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.87 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000908265  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.46 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.36 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.72 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.88 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  29.87 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  29.87 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.12 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000029403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.85 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2040  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.03 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1222  enhanced entry protein  31.05 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0332065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1268  enhanced entry protein EnhA  31.05 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.353847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.78 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2694  enhanced entry protein EnhA  28.64 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2566  enhanced entry protein EnhA  29.95 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  28.95 
 
 		 408 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  33.66 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  31.31 
 
 		 537 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  30.61 
 
 		 575 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  31.31 
 
 		 520 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  30.69 
 
 		 503 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  29.01 
 
 		 419 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  30.84 
 
 		 330 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0142  putative enhanced entry protein EnhA  28.72 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.387138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  30.61 
 
 		 588 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1236  enhanced entry protein  25.75 
 
 		 245 aa  52.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  30.3 
 
 		 493 aa  52.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  32.58 
 
 		 568 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2050  enhanced entry protein  28.72 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.752408  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  28.15 
 
 		 349 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  29.46 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1285  enhanced entry protein EnhA  26.2 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00169403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  25 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2219  hypothetical protein  23.28 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0511486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  29.73 
 
 		 347 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  29.73 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  28.57 
 
 		 411 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.2 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.84 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  24.78 
 
 		 536 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.78 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  25 
 
 		 496 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  25.22 
 
 		 503 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  27.91 
 
 		 455 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.29 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  29 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.68 
 
 		 211 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0412  LysM domain-containing protein  28.39 
 
 		 434 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2687  hypothetical protein  29.1 
 
 		 199 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.15 
 
 		 187 aa  42.7  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0434  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.78 
 
 		 266 aa  42.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  24.78 
 
 		 520 aa  42.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>