68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3565 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 294 aa  607  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.17 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000029403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.27 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.12 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.16 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  35 
 
 		 361 aa  72.4  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  35.65 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.66 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.88 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.89 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3161  hypothetical protein  29.08 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.36 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.26 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.78 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.14 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000908265  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  30.89 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.15 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  30.43 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  30.51 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  30.77 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0546  hypothetical protein  31.34 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.56 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.7 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.09 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  29.06 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1366  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.82 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  28.7 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1402  hypothetical protein  31.78 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.61 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.444945 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.93 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.29 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  30.17 
 
 		 575 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  27.74 
 
 		 568 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  29.31 
 
 		 493 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  27.69 
 
 		 408 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  29.31 
 
 		 520 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  28 
 
 		 537 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  28.45 
 
 		 503 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.2 
 
 		 215 aa  52.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  28.8 
 
 		 588 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  28 
 
 		 503 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.58 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  29.84 
 
 		 519 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  27.2 
 
 		 520 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  28 
 
 		 496 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  28 
 
 		 536 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4535  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.45 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.06 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.58 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0420468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2045  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.36 
 
 		 211 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.34 
 
 		 415 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.01 
 
 		 470 aa  46.6  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37170  hypothetical protein  27.66 
 
 		 404 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.955801  normal  0.0548238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1458  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.15 
 
 		 406 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.66 
 
 		 177 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.61 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  27.27 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1022  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.09 
 
 		 411 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.575167 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.11 
 
 		 866 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0772  hypothetical protein  30.16 
 
 		 163 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.8508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.81 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.83 
 
 		 170 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30 
 
 		 171 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2542  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.23 
 
 		 406 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>