73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0820 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 243 aa  507  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0420468 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.22 
 
 		 209 aa  148  8e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.43 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.72 
 
 		 187 aa  96.3  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  35.07 
 
 		 361 aa  82  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.11 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  31.69 
 
 		 568 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  30.72 
 
 		 575 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  30.56 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  32.86 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  31.03 
 
 		 503 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  30.99 
 
 		 588 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  32.86 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  32.86 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  31.11 
 
 		 537 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  32.09 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  30.77 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  31.43 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  28.08 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  31.43 
 
 		 418 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  33.33 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  29.09 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  29.93 
 
 		 536 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  29.87 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  31.71 
 
 		 496 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  33.04 
 
 		 519 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  34.82 
 
 		 455 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  32.48 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.13 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.93 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.16 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.87 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.48 
 
 		 170 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.19 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.92 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.87 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4535  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.74 
 
 		 345 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.13 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.58 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.86 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.23 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0177  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.5 
 
 		 341 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.34 
 
 		 370 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3298  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.13 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0078311  normal  0.0928852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.92 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.68 
 
 		 183 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1022  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.19 
 
 		 411 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.575167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11462  hypothetical protein  30.83 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.891259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.46 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.77 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.36 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.28 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.83 
 
 		 415 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.12 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.83 
 
 		 376 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.15 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.38 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.36 
 
 		 368 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.54 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2242  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25 
 
 		 427 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40808  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0141  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.73 
 
 		 328 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.68 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.73 
 
 		 328 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.6 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0160  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.73 
 
 		 328 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2100  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.37 
 
 		 427 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0449665  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.95 
 
 		 470 aa  42.4  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.34 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.12 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.47 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258239  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2980  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.81 
 
 		 300 aa  42  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.71 
 
 		 257 aa  41.6  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>