49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3161 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3161  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  590  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  92.66 
 
 		 290 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0546  hypothetical protein  61.83 
 
 		 266 aa  348  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1402  hypothetical protein  54.41 
 
 		 276 aa  298  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1366  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.17 
 
 		 281 aa  289  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.28 
 
 		 281 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.444945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.2 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.01 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.57 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.13 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.89 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.45 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.04 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000908265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.16 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.22 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.08 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.04 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.76 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  29.6 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  27.47 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.54 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000029403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2040  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.71 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1268  enhanced entry protein EnhA  30.98 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.353847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1222  enhanced entry protein  30.98 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0332065  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2566  enhanced entry protein EnhA  26.42 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2694  enhanced entry protein EnhA  26.42 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0142  putative enhanced entry protein EnhA  28.12 
 
 		 232 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.387138  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2050  enhanced entry protein  28.12 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.752408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  28.71 
 
 		 575 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1236  enhanced entry protein  26.2 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1285  enhanced entry protein EnhA  26.2 
 
 		 245 aa  49.3  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00169403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  27.72 
 
 		 568 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  29.7 
 
 		 520 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  27.73 
 
 		 537 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2219  hypothetical protein  24.24 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0511486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  26.98 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  29.13 
 
 		 503 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  26.98 
 
 		 361 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  25.74 
 
 		 588 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  25.44 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  25.89 
 
 		 419 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  27.72 
 
 		 493 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  28.04 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  27.42 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.68 
 
 		 370 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  27.45 
 
 		 520 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  29.46 
 
 		 354 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  24.53 
 
 		 418 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>