96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1788 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  61.76 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.48 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.85 
 
 		 368 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  62.14 
 
 		 139 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.45 
 
 		 184 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.58 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.87 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.39 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.02 
 
 		 211 aa  121  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46 
 
 		 253 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.07 
 
 		 269 aa  120  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.06 
 
 		 260 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.54 
 
 		 270 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.62 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.56 
 
 		 210 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.21 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  43.79 
 
 		 264 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.05 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.05 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.56 
 
 		 142 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.21 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.64 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.4 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  33.56 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.65 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.24 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.89 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0685  hypothetical protein  39.81 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.87 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.95 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.91 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.63 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.68 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 		 303 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.84 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.38 
 
 		 628 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 398 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  39.51 
 
 		 330 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 397 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.64 
 
 		 370 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.02 
 
 		 376 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  39.74 
 
 		 361 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  36.56 
 
 		 493 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  35.79 
 
 		 588 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0425  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.43 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.703074  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1762  enhanced entry protein  41.43 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.12 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  33 
 
 		 568 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  35 
 
 		 537 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  31 
 
 		 503 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  29.84 
 
 		 419 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.49 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.33 
 
 		 413 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.84 
 
 		 396 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  32.32 
 
 		 575 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.77 
 
 		 270 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.19 
 
 		 374 aa  45.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.09 
 
 		 332 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.73 
 
 		 481 aa  46.2  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.7 
 
 		 289 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 520 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.15 
 
 		 261 aa  45.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.04 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  32.41 
 
 		 349 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  32.46 
 
 		 418 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  32.73 
 
 		 354 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0707  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.93 
 
 		 304 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000409779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  33.03 
 
 		 347 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  35.4 
 
 		 503 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  31.4 
 
 		 344 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  36.25 
 
 		 264 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  36.78 
 
 		 455 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0930  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.59 
 
 		 357 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.37 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3251  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.59 
 
 		 366 aa  42.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0695  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.59 
 
 		 356 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.23 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG like protein  26.26 
 
 		 285 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2185  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.26 
 
 		 337 aa  42  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000508337  unclonable  0.0000000228332 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0448  hypothetical protein  29.89 
 
 		 315 aa  42  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  36.78 
 
 		 519 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1662  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.26 
 
 		 285 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2026  hypothetical protein  31.19 
 
 		 303 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198404  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0079  hypothetical protein  30.97 
 
 		 235 aa  42  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.45 
 
 		 307 aa  41.6  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1586  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.72 
 
 		 284 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  35.71 
 
 		 496 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1217  hypothetical protein  47.62 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0647  hypothetical protein  26.92 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.64 
 
 		 278 aa  41.2  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.2 
 
 		 272 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>