45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0079 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0079  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  487  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  59.87 
 
 
261 aa  194  7e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0726  hypothetical protein  46.58 
 
 
210 aa  135  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  42.17 
 
 
190 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1684  hypothetical protein  44.06 
 
 
446 aa  112  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271172 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0464  hypothetical protein  39.22 
 
 
228 aa  109  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.767953 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.69 
 
 
386 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.23 
 
 
386 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0727  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.69 
 
 
653 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.71 
 
 
762 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1454  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35 
 
 
156 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480002  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.09 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.65 
 
 
171 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.92 
 
 
170 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1468  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.93 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.04 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.76 
 
 
184 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  31.58 
 
 
361 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.82 
 
 
155 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.84 
 
 
177 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.41 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  28.37 
 
 
532 aa  46.2  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.93 
 
 
230 aa  45.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.27 
 
 
171 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.64 
 
 
112 aa  45.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.33 
 
 
370 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.65 
 
 
142 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.85 
 
 
326 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  38.46 
 
 
574 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  30.91 
 
 
507 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12539  lipoprotein lppS  28.1 
 
 
408 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.43439e-50  hitchhiker  0.00210001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4532  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.51 
 
 
406 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3141  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.92 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.65 
 
 
142 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.55 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.47 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.15 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.72 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.9 
 
 
498 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1260  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.89 
 
 
220 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 
541 aa  42.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.914763  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.19 
 
 
215 aa  42.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.68 
 
 
397 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.97 
 
 
190 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>