43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0649 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 		 261 aa  547  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0079  hypothetical protein  59.87 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  50.74 
 
 		 190 aa  125  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0726  hypothetical protein  48.67 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1684  hypothetical protein  44.68 
 
 		 446 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271172 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.45 
 
 		 218 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0464  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.767953 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.48 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.75 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0727  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.29 
 
 		 653 aa  59.3  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.66 
 
 		 762 aa  55.5  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.01 
 
 		 112 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1454  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.77 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480002  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.79 
 
 		 559 aa  48.5  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.203875 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.43 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.23 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.07 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.66 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.28 
 
 		 605 aa  45.8  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.95 
 
 		 212 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  41.94 
 
 		 574 aa  45.4  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.15 
 
 		 190 aa  45.8  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.83 
 
 		 183 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.6 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.15 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.68 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.29 
 
 		 376 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.97 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.6 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.72 
 
 		 389 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.01 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  28.7 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28 
 
 		 177 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.19 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.64 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.91 
 
 		 370 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.28 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.37 
 
 		 171 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3251  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.83 
 
 		 366 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  23.19 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2040  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.96 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  23.48 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  23.48 
 
 		 253 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0816159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>