113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2361 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
142 aa  293  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  95.31 
 
 
142 aa  258  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.04 
 
 
139 aa  143  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.95 
 
 
168 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.07 
 
 
211 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.11 
 
 
184 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.73 
 
 
190 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.57 
 
 
219 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.52 
 
 
210 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.54 
 
 
183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.83 
 
 
368 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.55 
 
 
270 aa  114  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.1 
 
 
214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.55 
 
 
251 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.55 
 
 
212 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.1 
 
 
214 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.41 
 
 
253 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.14 
 
 
270 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  40.97 
 
 
264 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.58 
 
 
260 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.63 
 
 
209 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.82 
 
 
269 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.18 
 
 
247 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.18 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.03 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0685  hypothetical protein  40.78 
 
 
293 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  36.61 
 
 
418 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  36.52 
 
 
330 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  37.27 
 
 
408 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  33.91 
 
 
361 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  36.72 
 
 
344 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  35.14 
 
 
411 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  37.61 
 
 
493 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  33.33 
 
 
347 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.34 
 
 
170 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  36.61 
 
 
419 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.63 
 
 
171 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.02 
 
 
250 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  36.51 
 
 
588 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.09 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.29 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  35.9 
 
 
503 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  37.74 
 
 
519 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  36.21 
 
 
520 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.31 
 
 
257 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  34.51 
 
 
568 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.71 
 
 
475 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  33.33 
 
 
575 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  38.04 
 
 
537 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.91 
 
 
370 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.96 
 
 
309 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.46 
 
 
481 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  37.74 
 
 
503 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  37.5 
 
 
349 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.42 
 
 
407 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
215 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.62 
 
 
303 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8817  hypothetical protein  28.8 
 
 
276 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.432511  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.26 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  36.79 
 
 
496 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 
295 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  36.45 
 
 
536 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.89 
 
 
307 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.63 
 
 
376 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.47 
 
 
236 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1762  enhanced entry protein  40.68 
 
 
214 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0425  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.68 
 
 
214 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.703074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.61 
 
 
278 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.33 
 
 
309 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.36 
 
 
266 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258239  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.04 
 
 
398 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0095  hypothetical protein  30.28 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  23.97 
 
 
205 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.3 
 
 
303 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.67 
 
 
396 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1341  hypothetical protein  45.1 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1337  hypothetical protein  45.1 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.33 
 
 
278 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000908265  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2050  enhanced entry protein  40.98 
 
 
249 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.752408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0142  putative enhanced entry protein EnhA  40.98 
 
 
232 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.387138  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0079  hypothetical protein  30.65 
 
 
235 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.65 
 
 
171 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0972  hypothetical protein  45 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  35.82 
 
 
248 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2863  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.14 
 
 
339 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.772314  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0942  hypothetical protein  45 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  35.82 
 
 
248 aa  42.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  34.62 
 
 
455 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.93 
 
 
413 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.14 
 
 
397 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.4 
 
 
217 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0759  hypothetical protein  34.25 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0741  hypothetical protein  34.25 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  24.17 
 
 
332 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.69 
 
 
278 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1236  enhanced entry protein  36.92 
 
 
245 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1285  enhanced entry protein EnhA  36.92 
 
 
245 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00169403  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  32.2 
 
 
520 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.46 
 
 
243 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>