51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5175 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 475 aa  919    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.89 
 
 		 144 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  41.67 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  34.26 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  38 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  42.05 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  42.05 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.42 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  37.23 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  35.42 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  32.41 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.48 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  30.83 
 
 		 503 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  30.77 
 
 		 536 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.79 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  30.71 
 
 		 520 aa  57  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  35.29 
 
 		 493 aa  57  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  34.04 
 
 		 455 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6096  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.34 
 
 		 254 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.71 
 
 		 142 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  29.82 
 
 		 568 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  35.63 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.71 
 
 		 142 aa  53.5  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.73 
 
 		 247 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.93 
 
 		 211 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.28 
 
 		 219 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.39 
 
 		 368 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.35 
 
 		 303 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  32.94 
 
 		 520 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  32.94 
 
 		 503 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  34.12 
 
 		 537 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.94 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  34.12 
 
 		 588 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  33.66 
 
 		 575 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  37.31 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.75 
 
 		 260 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  30.77 
 
 		 411 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.5 
 
 		 214 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.86 
 
 		 270 aa  46.6  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.5 
 
 		 270 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 		 210 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  35.82 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 		 214 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 		 187 aa  45.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0282  hypothetical protein  29.86 
 
 		 767 aa  44.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.14346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.25 
 
 		 251 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  37.04 
 
 		 694 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.19 
 
 		 183 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  36.47 
 
 		 264 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.28 
 
 		 253 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.382992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>