141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1013    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  29.13 
 
 
574 aa  162  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  24.55 
 
 
605 aa  151  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  25.76 
 
 
531 aa  123  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  24.57 
 
 
521 aa  109  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.19 
 
 
206 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.4 
 
 
155 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.98 
 
 
177 aa  98.2  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.74 
 
 
396 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.8 
 
 
257 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.26 
 
 
171 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.65 
 
 
413 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.27 
 
 
370 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.98 
 
 
628 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.67 
 
 
171 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.62 
 
 
407 aa  86.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.89 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.59 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.23 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.06 
 
 
170 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.69 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.37 
 
 
866 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.9 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  24.44 
 
 
514 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  21.71 
 
 
498 aa  76.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  24.84 
 
 
670 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2208  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  22.02 
 
 
552 aa  74.7  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.827056  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1160  hypothetical protein  45.78 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.74704  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  22.13 
 
 
492 aa  68.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  24.76 
 
 
675 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  22.03 
 
 
520 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  22.91 
 
 
686 aa  64.7  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.36 
 
 
541 aa  61.6  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.914763  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  21.25 
 
 
559 aa  59.7  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.203875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1054  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.38 
 
 
400 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2863  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.23 
 
 
339 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.772314  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1222  enhanced entry protein  30.43 
 
 
253 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0332065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1268  enhanced entry protein EnhA  30.43 
 
 
252 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.353847  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  25.08 
 
 
636 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2050  enhanced entry protein  29.75 
 
 
249 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.752408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  31.25 
 
 
248 aa  54.3  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0142  putative enhanced entry protein EnhA  29.75 
 
 
232 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.387138  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  31.25 
 
 
248 aa  53.9  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.63 
 
 
415 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3147  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.26 
 
 
431 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5894  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.51 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  31.68 
 
 
565 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
386 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5983  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.28 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.538368  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  24.06 
 
 
636 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1018  hypothetical protein  40 
 
 
450 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4535  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.64 
 
 
345 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2244  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36 
 
 
476 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111887  decreased coverage  0.00847254 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.52 
 
 
235 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3641  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.08 
 
 
406 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0709667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
386 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.08 
 
 
406 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758316  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3646  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.08 
 
 
406 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.759222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  30.6 
 
 
496 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  31.67 
 
 
536 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1684  hypothetical protein  32.87 
 
 
446 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271172 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  24.09 
 
 
579 aa  50.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12539  lipoprotein lppS  35.79 
 
 
408 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.43439e-50  hitchhiker  0.00210001 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.7 
 
 
215 aa  50.1  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6096  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.25 
 
 
254 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.08 
 
 
272 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  27.93 
 
 
436 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  30.6 
 
 
503 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5854  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.89 
 
 
407 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0479  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.89 
 
 
323 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.035674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  29.69 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.92 
 
 
250 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  25.86 
 
 
633 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  26.61 
 
 
847 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4102  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.63 
 
 
406 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00342341  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.93 
 
 
257 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5721  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
407 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.517786  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  23.69 
 
 
677 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5287  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
407 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.070896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  29.01 
 
 
354 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2157  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
417 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125503  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1236  enhanced entry protein  30 
 
 
245 aa  48.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1285  enhanced entry protein EnhA  30 
 
 
245 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00169403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  31.01 
 
 
361 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2566  enhanced entry protein EnhA  27.33 
 
 
235 aa  47.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  29.01 
 
 
347 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.01 
 
 
247 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0904  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
407 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2694  enhanced entry protein EnhA  29.51 
 
 
240 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1448  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.78 
 
 
406 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1466  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
406 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333999  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0177  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.92 
 
 
341 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
407 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.14 
 
 
276 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  29.57 
 
 
408 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.79 
 
 
470 aa  47.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4556  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
407 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.745209  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2542  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.83 
 
 
406 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.37 
 
 
218 aa  47  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5369  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.64 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846692  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>