56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03640 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  100 
 
 
521 aa  1061    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.8 
 
 
498 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2208  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.08 
 
 
552 aa  368  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.827056  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.87 
 
 
492 aa  342  1e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  34.87 
 
 
514 aa  301  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.05 
 
 
559 aa  239  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.203875 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.24 
 
 
470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3256  hypothetical protein  30.69 
 
 
481 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.218487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2989  hypothetical protein  29.72 
 
 
482 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3238  hypothetical protein  29.72 
 
 
481 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3224  hypothetical protein  30.22 
 
 
498 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2927  hypothetical protein  30.43 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3002  hypothetical protein  28.94 
 
 
482 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0878761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2947  hypothetical protein  29.95 
 
 
481 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0687281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2030  hypothetical protein  30.68 
 
 
481 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.533222  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3259  hypothetical protein  30.58 
 
 
481 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3232  hypothetical protein  28.94 
 
 
481 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0040  hypothetical protein  28.69 
 
 
464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  25.34 
 
 
507 aa  94.7  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1698  hypothetical protein  30.7 
 
 
417 aa  92  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41368e-16 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  24.9 
 
 
531 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.12 
 
 
370 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.08 
 
 
201 aa  63.9  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.2 
 
 
397 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.8 
 
 
376 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.6 
 
 
398 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.75 
 
 
303 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.08 
 
 
374 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.65 
 
 
396 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  28.22 
 
 
330 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.11 
 
 
866 aa  54.7  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.52 
 
 
413 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  21.44 
 
 
605 aa  52.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.03 
 
 
177 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  32.46 
 
 
344 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.81 
 
 
171 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.68 
 
 
300 aa  51.2  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.25 
 
 
415 aa  50.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  22.4 
 
 
633 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.46 
 
 
142 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.46 
 
 
256 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.23 
 
 
264 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.52 
 
 
257 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.38 
 
 
215 aa  46.6  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.73 
 
 
276 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1022  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.85 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.575167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0095  hypothetical protein  28.24 
 
 
143 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  25.78 
 
 
568 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  28.57 
 
 
361 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1160  hypothetical protein  30.4 
 
 
350 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.74704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2000  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.81 
 
 
404 aa  44.3  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5256  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.91 
 
 
524 aa  43.9  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210473  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  30 
 
 
455 aa  43.5  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  25.75 
 
 
579 aa  43.5  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1018  hypothetical protein  31.88 
 
 
450 aa  43.5  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.78 
 
 
206 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>