73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4116 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 
455 aa  933    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  54.99 
 
 
457 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0613  SCP-like extracellular  66.09 
 
 
329 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170655  normal  0.096585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3504  Allergen V5/Tpx-1 family protein  64.38 
 
 
331 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0639  SCP-like extracellular  57.84 
 
 
283 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  58.57 
 
 
384 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  58.45 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  61.83 
 
 
803 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  61.29 
 
 
801 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.95 
 
 
689 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  54.64 
 
 
492 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  38.64 
 
 
347 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.2 
 
 
688 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.3 
 
 
597 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  54.89 
 
 
340 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  38.68 
 
 
374 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  48.73 
 
 
338 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  41.87 
 
 
376 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  42.72 
 
 
376 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  38.26 
 
 
374 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  39.46 
 
 
653 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.57 
 
 
638 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.5 
 
 
722 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  44.2 
 
 
654 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  38.11 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  44.56 
 
 
451 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  42.27 
 
 
345 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  45.08 
 
 
334 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  42.03 
 
 
415 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  41.47 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  41.18 
 
 
642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  42.41 
 
 
662 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  40.29 
 
 
635 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  39.07 
 
 
235 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  39.89 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  35.27 
 
 
281 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  33.59 
 
 
354 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  38.46 
 
 
656 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  38.5 
 
 
665 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.91 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  32.81 
 
 
586 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.34 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  36.41 
 
 
480 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  38.86 
 
 
283 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  35.98 
 
 
350 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  34.93 
 
 
596 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  32.04 
 
 
459 aa  90.1  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3503  hypothetical protein  57.89 
 
 
131 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  33.61 
 
 
597 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  32.88 
 
 
601 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  36.92 
 
 
600 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  32.88 
 
 
601 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.21 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.14 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.1 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  36.84 
 
 
306 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.28 
 
 
397 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.64 
 
 
500 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.29 
 
 
370 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3299  SCP-like extracellular  32.88 
 
 
342 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000136792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.52 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2680  SCP-like extracellular  26.1 
 
 
417 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  28.18 
 
 
804 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.64 
 
 
862 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  31.79 
 
 
188 aa  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  27.34 
 
 
327 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  31.37 
 
 
285 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  30.28 
 
 
270 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.34 
 
 
432 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  28.85 
 
 
244 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  22.79 
 
 
382 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  29.1 
 
 
260 aa  43.5  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3424  SCP-like extracellular  30.19 
 
 
138 aa  43.1  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.492654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>