77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3040 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  746    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  60.72 
 
 
392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  62.21 
 
 
380 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  51.89 
 
 
369 aa  353  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  27.53 
 
 
550 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  28.04 
 
 
550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  27 
 
 
1025 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  29.33 
 
 
596 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  26.77 
 
 
544 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  28.05 
 
 
600 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  28.45 
 
 
597 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  26.11 
 
 
408 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  30.18 
 
 
586 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  27.03 
 
 
450 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  27.03 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  28.18 
 
 
434 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  33.47 
 
 
891 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  28.13 
 
 
601 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  28.13 
 
 
601 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  29.48 
 
 
447 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  25.67 
 
 
446 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  28.38 
 
 
453 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  30.08 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  33.05 
 
 
803 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  26.37 
 
 
476 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  26.95 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  31.47 
 
 
801 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  26.85 
 
 
340 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  26.71 
 
 
436 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  31.13 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  27.5 
 
 
596 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  29.49 
 
 
602 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  28.06 
 
 
534 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  33.48 
 
 
604 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  23.65 
 
 
1141 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  25.92 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  31.21 
 
 
1276 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.93 
 
 
584 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  28.5 
 
 
558 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  24.52 
 
 
510 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  27.75 
 
 
510 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  27.75 
 
 
510 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  27.75 
 
 
510 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  27.75 
 
 
510 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  22 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  26.05 
 
 
481 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  29.07 
 
 
500 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  26.52 
 
 
654 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  29.78 
 
 
508 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  27.81 
 
 
452 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  26.52 
 
 
605 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  33.91 
 
 
1086 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1931  hypothetical protein  29.19 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00823138  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  29.31 
 
 
873 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  29.1 
 
 
444 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  27.84 
 
 
442 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  27.84 
 
 
442 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  27.84 
 
 
442 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  27.84 
 
 
442 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  27.84 
 
 
442 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  27.84 
 
 
442 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  27.84 
 
 
442 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  27.44 
 
 
472 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 
437 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  28.27 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  28.27 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  28.27 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  23.25 
 
 
489 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  26.63 
 
 
442 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  23.47 
 
 
662 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  26.94 
 
 
457 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  25.81 
 
 
614 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  30.22 
 
 
468 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  26.13 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3601  hypothetical protein  41.79 
 
 
465 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1927  hypothetical protein  32.57 
 
 
478 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.177201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>