44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3885 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  82.44 
 
 		 500 aa  826    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1035    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1027  hypothetical protein  42.89 
 
 		 464 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0399  hypothetical protein  45.31 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  34.45 
 
 		 654 aa  173  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  27.6 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  30.51 
 
 		 803 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  25.53 
 
 		 1276 aa  73.6  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  27.46 
 
 		 604 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  30.58 
 
 		 801 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  26.03 
 
 		 584 aa  70.1  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  28.27 
 
 		 602 aa  67.4  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.36 
 
 		 873 aa  64.3  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  27.98 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  27.23 
 
 		 891 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  25.34 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  27.23 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  27.23 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  25.55 
 
 		 605 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  26.75 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  21.46 
 
 		 662 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1086 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  27.19 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  26.16 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  22.72 
 
 		 1141 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  30.21 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  24.09 
 
 		 614 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  26.01 
 
 		 340 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  26.9 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  27.68 
 
 		 586 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  23.92 
 
 		 600 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  23.75 
 
 		 437 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  29.78 
 
 		 372 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  30.95 
 
 		 780 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  26.2 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  28.57 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  21.81 
 
 		 398 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  26.2 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  26.2 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  28.72 
 
 		 562 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  24.76 
 
 		 534 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>