76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0356 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  753    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  50.54 
 
 
392 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  53.3 
 
 
372 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  51.16 
 
 
380 aa  322  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  27.13 
 
 
550 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  28.31 
 
 
544 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  27.11 
 
 
550 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  29.48 
 
 
596 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  28.92 
 
 
597 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  27.03 
 
 
600 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  25.26 
 
 
1025 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  27.09 
 
 
447 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  27.11 
 
 
434 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  26.82 
 
 
453 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  26.27 
 
 
476 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  24.38 
 
 
408 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  30.61 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  26.34 
 
 
891 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  26.15 
 
 
601 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  26.98 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  26.15 
 
 
601 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  33.7 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  26.11 
 
 
596 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  31.43 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  24.13 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  25.15 
 
 
586 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  23.1 
 
 
461 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  23.12 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  28.31 
 
 
604 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  22.51 
 
 
446 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  28.67 
 
 
801 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  28.44 
 
 
442 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  28.44 
 
 
442 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  28.44 
 
 
442 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  28.44 
 
 
442 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  28.44 
 
 
442 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  28.44 
 
 
442 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  28.44 
 
 
442 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  26.21 
 
 
584 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  25.97 
 
 
534 aa  56.6  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  30.59 
 
 
803 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  23.56 
 
 
437 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  28.93 
 
 
1276 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  33.85 
 
 
602 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  23.05 
 
 
1141 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  24.25 
 
 
662 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  28.22 
 
 
450 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  29.46 
 
 
873 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  23.83 
 
 
501 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  28.64 
 
 
450 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  28.64 
 
 
450 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  28.64 
 
 
450 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  24.11 
 
 
437 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  23.23 
 
 
530 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  29.47 
 
 
500 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  26.67 
 
 
510 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  26.67 
 
 
510 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  26.67 
 
 
510 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  26.67 
 
 
510 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  26.67 
 
 
510 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  26.67 
 
 
452 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  25.9 
 
 
444 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  23.98 
 
 
558 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  23.83 
 
 
605 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  29.06 
 
 
468 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  21.07 
 
 
460 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  26.9 
 
 
508 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  28.91 
 
 
503 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  23.58 
 
 
489 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  29.59 
 
 
520 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  25.13 
 
 
654 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  25.61 
 
 
472 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2658  hypothetical protein  23.18 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3044  hypothetical protein  26.32 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139878  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  25.1 
 
 
448 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  22.86 
 
 
326 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>