55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1875 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  100 
 
 
510 aa  1043    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  90.78 
 
 
558 aa  944    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  99.22 
 
 
510 aa  1034    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  99.22 
 
 
510 aa  1034    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  99.61 
 
 
510 aa  1040    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  99.22 
 
 
510 aa  1036    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  99.12 
 
 
452 aa  914    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  28.95 
 
 
596 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  25.52 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  25.56 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  24.37 
 
 
891 aa  67.8  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  24.77 
 
 
1025 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  27.91 
 
 
446 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  26.96 
 
 
340 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  32.14 
 
 
801 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  26.14 
 
 
481 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  25.56 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  29.27 
 
 
472 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  25.77 
 
 
476 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  29.52 
 
 
534 aa  60.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  27.23 
 
 
500 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  22.89 
 
 
596 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  23.1 
 
 
550 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  25.63 
 
 
444 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  33.74 
 
 
602 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  27.23 
 
 
508 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  25.68 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  27.17 
 
 
584 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  32.52 
 
 
604 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  30.56 
 
 
803 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  27.19 
 
 
425 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  27.72 
 
 
444 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  22.71 
 
 
597 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  23.37 
 
 
408 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.65 
 
 
415 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  23.17 
 
 
600 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  26.92 
 
 
453 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  23.51 
 
 
550 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  26.09 
 
 
586 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  25.43 
 
 
372 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  25.7 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  24.23 
 
 
662 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  26.67 
 
 
369 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  21.11 
 
 
544 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  26.51 
 
 
436 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  26.24 
 
 
326 aa  47.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  24.78 
 
 
450 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  24.18 
 
 
1141 aa  47.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  26.54 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  22.83 
 
 
601 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  26.67 
 
 
873 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  21.99 
 
 
601 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  25.9 
 
 
614 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  24.16 
 
 
461 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  25.62 
 
 
605 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>