73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3520 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  90.96 
 
 		 392 aa  702    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  765    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  61.85 
 
 		 372 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  50.41 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  32.26 
 
 		 550 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  32.84 
 
 		 550 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  30.22 
 
 		 1025 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  28.28 
 
 		 544 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  29.01 
 
 		 596 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  29.34 
 
 		 597 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  28.81 
 
 		 600 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  31.69 
 
 		 891 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  32.69 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  28.88 
 
 		 601 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  28.88 
 
 		 601 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  30.95 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  29.39 
 
 		 476 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  28.7 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  26.23 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  28.33 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  26.74 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  27.74 
 
 		 1276 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  26.45 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  34.6 
 
 		 801 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  35.02 
 
 		 803 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  27.35 
 
 		 584 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  25.51 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  32.07 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  27.48 
 
 		 534 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  28.04 
 
 		 604 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  28.57 
 
 		 602 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  26.2 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  26.32 
 
 		 596 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  26.23 
 
 		 586 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  28.9 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  27.08 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  25.24 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  25.56 
 
 		 510 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  25.24 
 
 		 510 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  25.24 
 
 		 510 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  25.57 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  25.26 
 
 		 662 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  25.97 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  27.97 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  21.92 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  24.76 
 
 		 1141 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.69 
 
 		 873 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  26.43 
 
 		 654 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  24.7 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1086 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  24.4 
 
 		 481 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  28.57 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  28.57 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  28.57 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  27.38 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  30.69 
 
 		 508 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  22.53 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  26.86 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  26.86 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  26.86 
 
 		 442 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  26.86 
 
 		 442 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  26.86 
 
 		 442 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  26.86 
 
 		 442 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  26.86 
 
 		 442 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  26.23 
 
 		 614 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  30.16 
 
 		 500 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  26.38 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1931  hypothetical protein  27.65 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00823138  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  24.43 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  24.47 
 
 		 489 aa  42.7  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  28.17 
 
 		 532 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>