75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3853 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  74.11 
 
 
562 aa  819    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  100 
 
 
564 aa  1152    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  49.64 
 
 
554 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  33.77 
 
 
1276 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  28.46 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  27.39 
 
 
1086 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  30.42 
 
 
891 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  30.95 
 
 
450 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  30.95 
 
 
450 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  30.95 
 
 
450 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  28.12 
 
 
1141 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  26.49 
 
 
326 aa  97.1  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  27.62 
 
 
534 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  28.07 
 
 
662 aa  93.6  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.17 
 
 
873 aa  92  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  29.55 
 
 
450 aa  91.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  27.84 
 
 
442 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  27.84 
 
 
442 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  27.84 
 
 
442 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  27.84 
 
 
442 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  27.84 
 
 
442 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  27.84 
 
 
442 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  27.84 
 
 
442 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  29.98 
 
 
803 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  25.44 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  27.44 
 
 
602 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  26.48 
 
 
596 aa  82  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  26.48 
 
 
605 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  25.79 
 
 
614 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  29.48 
 
 
801 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  26.07 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  25.64 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.16 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  28.12 
 
 
604 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  28.53 
 
 
398 aa  70.1  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  22.88 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  23.33 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.51 
 
 
584 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  23.14 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  24.28 
 
 
482 aa  67.8  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  22.63 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  25 
 
 
436 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  21.75 
 
 
447 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  24.11 
 
 
425 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  23.35 
 
 
444 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  22.87 
 
 
596 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0399  hypothetical protein  24.4 
 
 
432 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  26.13 
 
 
444 aa  57  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  24.88 
 
 
654 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  22.69 
 
 
597 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  22.19 
 
 
340 aa  54.7  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  24 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  41.57 
 
 
417 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  27.33 
 
 
446 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  23.48 
 
 
442 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  22.7 
 
 
586 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  22.94 
 
 
442 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  25.76 
 
 
426 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  21.61 
 
 
601 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  26.17 
 
 
500 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  21.6 
 
 
437 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1027  hypothetical protein  24.14 
 
 
464 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  28.68 
 
 
550 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  24.86 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  24.86 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  24.86 
 
 
510 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  24.86 
 
 
510 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  24.86 
 
 
510 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  21.39 
 
 
601 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  28.18 
 
 
369 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  20.43 
 
 
600 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  25 
 
 
452 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  25.93 
 
 
382 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  27.94 
 
 
550 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  34.21 
 
 
558 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>