62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5546 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  936    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  31.85 
 
 		 326 aa  170  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  31.67 
 
 		 554 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  30.68 
 
 		 1276 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  28.46 
 
 		 564 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  29.77 
 
 		 562 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  32.38 
 
 		 482 aa  119  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  27.88 
 
 		 489 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  28.07 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1086 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  29.03 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  29.03 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  29.03 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  25.55 
 
 		 873 aa  90.1  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  25 
 
 		 614 aa  79.7  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  27.62 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  28.57 
 
 		 662 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  28.42 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  28.42 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  28.42 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  28.42 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  28.42 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  28.42 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  28.42 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  26.67 
 
 		 534 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  26.7 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  24.65 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  26.58 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  25.53 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  26.32 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  27.8 
 
 		 604 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  22.94 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  27.91 
 
 		 602 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  25.38 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  21.84 
 
 		 1141 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  24.17 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  22.37 
 
 		 605 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  23.41 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  23.17 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  25.56 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  23.47 
 
 		 600 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  22.97 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  25.85 
 
 		 803 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  24.92 
 
 		 891 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  25.39 
 
 		 801 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  23.6 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  22.15 
 
 		 780 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  23.31 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  23.34 
 
 		 601 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  23.34 
 
 		 601 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  29.69 
 
 		 621 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  23.79 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  23.44 
 
 		 340 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 		 684 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0393  hypothetical protein  26.58 
 
 		 394 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  25 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  21.34 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3567  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1798 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  23.81 
 
 		 584 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2843  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta- galactosidase  26.15 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>