210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1260 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  73.08 
 
 		 171 aa  204  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  72.09 
 
 		 168 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  63.16 
 
 		 170 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  57.59 
 
 		 162 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  57.59 
 
 		 162 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  55.7 
 
 		 163 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  57.46 
 
 		 166 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  52.47 
 
 		 164 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  48.08 
 
 		 160 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  48.43 
 
 		 160 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  48.34 
 
 		 159 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  46.5 
 
 		 159 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  45.96 
 
 		 159 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  55.46 
 
 		 164 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  47.8 
 
 		 158 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  45.12 
 
 		 159 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  44.58 
 
 		 171 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  49.31 
 
 		 163 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  47.02 
 
 		 159 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  46.76 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  47.68 
 
 		 160 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  46.81 
 
 		 159 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  44.72 
 
 		 166 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  49.62 
 
 		 153 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  41.36 
 
 		 160 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  41.29 
 
 		 156 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  44.44 
 
 		 161 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  43.85 
 
 		 151 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  41.98 
 
 		 166 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  41.98 
 
 		 164 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  44.03 
 
 		 160 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  40.12 
 
 		 165 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  44.19 
 
 		 154 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  41.04 
 
 		 156 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  39.37 
 
 		 180 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  39.55 
 
 		 176 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  37.82 
 
 		 182 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  40.14 
 
 		 177 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  69.7 
 
 		 117 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  37.97 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  40 
 
 		 177 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  38.96 
 
 		 177 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  62.86 
 
 		 118 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  37.18 
 
 		 175 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  37.84 
 
 		 167 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  36.54 
 
 		 175 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  45.61 
 
 		 121 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  44.74 
 
 		 118 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  34.74 
 
 		 189 aa  92  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  44.74 
 
 		 118 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.11 
 
 		 175 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  54.79 
 
 		 116 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  32.53 
 
 		 169 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  52.05 
 
 		 115 aa  89  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  54.29 
 
 		 115 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  56.52 
 
 		 115 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  57.14 
 
 		 116 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  60.56 
 
 		 94 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  53.42 
 
 		 95 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  59.72 
 
 		 114 aa  86.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  47.73 
 
 		 114 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  47.73 
 
 		 114 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  47.73 
 
 		 114 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  32.39 
 
 		 185 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  55.7 
 
 		 114 aa  85.5  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  56.76 
 
 		 101 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  51.76 
 
 		 113 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  55.71 
 
 		 123 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  55.07 
 
 		 115 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  54.29 
 
 		 116 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  44.76 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  59.15 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  52.17 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  52.78 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  61.54 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  58.9 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  56.94 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  57.75 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  55.88 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  52.17 
 
 		 115 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  54.29 
 
 		 108 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  54.29 
 
 		 108 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  52.17 
 
 		 120 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  53.73 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  37.29 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  53.62 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  57.75 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  35.59 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  49.32 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  49.32 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  37.17 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  44.32 
 
 		 122 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  46.58 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  45.83 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  50.72 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  42.53 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  48.65 
 
 		 123 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  43.06 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>