27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1142 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1142  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 
153 aa  315  2e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.036139 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1542  blue (type1) copper domain-containing protein  77.27 
 
 
154 aa  243  6.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  43.48 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  38.74 
 
 
358 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  38.33 
 
 
623 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  41.3 
 
 
315 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  40.66 
 
 
270 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  34.26 
 
 
287 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  34.88 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  41.94 
 
 
318 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  38.46 
 
 
444 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  34.25 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  36.11 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  34.78 
 
 
454 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  32.67 
 
 
539 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  38.16 
 
 
264 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  33.71 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  34.57 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  30.53 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  27.27 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  28.57 
 
 
110 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  34.07 
 
 
114 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  29.67 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  29.41 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  36.76 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  36.36 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>