23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0533 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0533  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  343  7e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.528363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  47.37 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0200  hypothetical protein  40.71 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  39.13 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  45.45 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  36.25 
 
 		 123 aa  50.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  38.57 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  30.15 
 
 		 539 aa  49.3  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  42.42 
 
 		 97 aa  48.5  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1546  hypothetical protein  35.16 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  38.75 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  38.75 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  38.27 
 
 		 358 aa  45.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  35.29 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  48.39 
 
 		 248 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  34.72 
 
 		 264 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  31.91 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  38.71 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  38.71 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  41.27 
 
 		 444 aa  43.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 		 152 aa  42  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 		 120 aa  41.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  32.81 
 
 		 623 aa  41.2  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>