33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1576 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  342  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  59.86 
 
 
147 aa  180  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  59.31 
 
 
157 aa  177  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  49.02 
 
 
153 aa  148  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  37.6 
 
 
150 aa  87.8  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0385  hypothetical protein  37.4 
 
 
146 aa  84.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1949  hypothetical protein  32.2 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129845  normal  0.699527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  25.2 
 
 
160 aa  57.4  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  24.41 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  27.21 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  31 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  27.18 
 
 
314 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  32.08 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  31.78 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  28.33 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  56.1 
 
 
143 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  28.15 
 
 
140 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  26.13 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  26.61 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  24.56 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1799  hypothetical protein  27.2 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  28.21 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  29.31 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1848  hypothetical protein  28.83 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.831934 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  28.33 
 
 
116 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  26.92 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2183  hypothetical protein  28.83 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713238  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  29.37 
 
 
127 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  28.57 
 
 
116 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  25.5 
 
 
159 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  26.32 
 
 
160 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  27.5 
 
 
116 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>