24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1734 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1734  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0063943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0660  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1071  hypothetical protein  41.76 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3225  cell surface lipoprotein  44 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00779237  normal  0.0523754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3226  hypothetical protein  44.12 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0283497 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  27.31 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  32.38 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  31.09 
 
 		 121 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1921  blue (type1) copper domain-containing protein  30.17 
 
 		 126 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  28.46 
 
 		 119 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  34.95 
 
 		 119 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  34.95 
 
 		 119 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  33.33 
 
 		 125 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  29.51 
 
 		 192 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  32.88 
 
 		 124 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  31.07 
 
 		 97 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  28.97 
 
 		 109 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  31.94 
 
 		 72 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  30.09 
 
 		 110 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  25.45 
 
 		 116 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  31.33 
 
 		 136 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  29.07 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  27.83 
 
 		 114 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  29.17 
 
 		 114 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>