29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3225 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3225  cell surface lipoprotein  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00779237  normal  0.0523754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3226  hypothetical protein  34.25 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0283497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0660  hypothetical protein  42.53 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1071  hypothetical protein  44.44 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1734  hypothetical protein  44 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0063943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  35.37 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 97 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  30.12 
 
 		 112 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  30.12 
 
 		 112 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  30.12 
 
 		 112 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  27.71 
 
 		 114 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  30.12 
 
 		 113 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  32.86 
 
 		 444 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  30.26 
 
 		 358 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  26.53 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  34.62 
 
 		 112 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  32.58 
 
 		 114 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  29.11 
 
 		 114 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  37.14 
 
 		 85 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  30.12 
 
 		 113 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  28.92 
 
 		 110 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  29.11 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  27.59 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  27.71 
 
 		 104 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  26.92 
 
 		 97 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  29.33 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 123 aa  42.7  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  32.5 
 
 		 150 aa  42  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  25.55 
 
 		 539 aa  41.6  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>