22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0030 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0030  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  668    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  45.52 
 
 
556 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  39.55 
 
 
623 aa  94.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1636  hypothetical protein  29.51 
 
 
517 aa  93.6  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1648  hypothetical protein  35.04 
 
 
572 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  38.46 
 
 
903 aa  90.1  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0467  hypothetical protein  33.33 
 
 
473 aa  87.4  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0035824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1087  hypothetical protein  33.08 
 
 
518 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  32.21 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0333  hypothetical protein  32.85 
 
 
1042 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0973  hypothetical protein  30.83 
 
 
299 aa  77  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.149574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0986  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1647  hypothetical protein  31.3 
 
 
531 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1638  hypothetical protein  29.77 
 
 
623 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0864  hypothetical protein  69.05 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00415115 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1644  hypothetical protein  27.14 
 
 
386 aa  56.2  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  25 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0875  phosphonate ABC transporter periplasmic phosphonate-binding protein  42.5 
 
 
362 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122737 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  40.91 
 
 
174 aa  49.7  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0479  phosphate ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  45.95 
 
 
417 aa  49.3  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.719284 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  41.46 
 
 
167 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1639  hypothetical protein  27.42 
 
 
443 aa  46.6  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>