32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12818 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12818  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.562782  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  28.57 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  36.96 
 
 		 874 aa  57.8  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  42.31 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  37.5 
 
 		 693 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  28.75 
 
 		 1441 aa  51.6  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  40.79 
 
 		 136 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  39.44 
 
 		 119 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  41.77 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  30 
 
 		 1070 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  34.78 
 
 		 127 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  36.99 
 
 		 1302 aa  45.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  32.89 
 
 		 957 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  42.67 
 
 		 114 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  29.17 
 
 		 757 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  33.62 
 
 		 1527 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  36.11 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3421  hypothetical protein  30.12 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  40 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1394 aa  42.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  28.57 
 
 		 550 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  35.48 
 
 		 1437 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  33.77 
 
 		 957 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  43.59 
 
 		 623 aa  42.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  29.63 
 
 		 2334 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  27.59 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1647  hypothetical protein  31.08 
 
 		 639 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.201062  normal  0.0771148 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  30.19 
 
 		 655 aa  41.6  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  30 
 
 		 461 aa  41.6  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3849  Parallel beta-helix repeat protein  29.17 
 
 		 526 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  29.67 
 
 		 669 aa  41.6  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1031 aa  41.6  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>