108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1341 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 1668 aa  3308    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1518 aa  324  9.000000000000001e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  46.67 
 
 		 341 aa  171  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  42.63 
 
 		 1147 aa  157  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  43.26 
 
 		 646 aa  155  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  38.42 
 
 		 340 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  40 
 
 		 1437 aa  140  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  40.68 
 
 		 755 aa  139  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  34.89 
 
 		 1003 aa  138  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  38.67 
 
 		 333 aa  138  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  39.15 
 
 		 362 aa  137  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  40.83 
 
 		 336 aa  136  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  37.74 
 
 		 491 aa  136  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  36.76 
 
 		 501 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  38.55 
 
 		 1433 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  40 
 
 		 495 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  40.91 
 
 		 1029 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  38.15 
 
 		 700 aa  127  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  36.52 
 
 		 371 aa  126  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  36.11 
 
 		 324 aa  123  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  36.67 
 
 		 541 aa  122  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  37.37 
 
 		 571 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.78 
 
 		 1773 aa  112  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  38.76 
 
 		 657 aa  110  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  32.85 
 
 		 477 aa  108  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  31.89 
 
 		 757 aa  105  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  35.26 
 
 		 571 aa  105  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  34.57 
 
 		 394 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  45.3 
 
 		 1296 aa  105  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  33 
 
 		 1174 aa  102  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.81 
 
 		 1015 aa  101  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  30.51 
 
 		 996 aa  101  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  38.96 
 
 		 1575 aa  98.6  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1294 aa  98.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  31.91 
 
 		 558 aa  97.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1215 aa  94.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  39.64 
 
 		 408 aa  92.8  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.29 
 
 		 665 aa  91.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1055 aa  91.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  29.57 
 
 		 846 aa  88.6  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  29.38 
 
 		 736 aa  87.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  27.06 
 
 		 2924 aa  87  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  30.49 
 
 		 634 aa  84.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  43.18 
 
 		 308 aa  84.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  28.09 
 
 		 803 aa  84.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  26.04 
 
 		 688 aa  83.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  30.67 
 
 		 686 aa  80.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  31.52 
 
 		 725 aa  81.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  32.28 
 
 		 601 aa  80.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  28.98 
 
 		 693 aa  79.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.77 
 
 		 900 aa  77.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  29.83 
 
 		 376 aa  77  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  30.73 
 
 		 543 aa  77  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.98 
 
 		 570 aa  76.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1263 aa  75.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1318 aa  72.8  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  28.97 
 
 		 2555 aa  72  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  32.32 
 
 		 933 aa  72  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.69 
 
 		 1797 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.53 
 
 		 1783 aa  69.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  35.9 
 
 		 221 aa  68.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  29.47 
 
 		 347 aa  68.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  32.18 
 
 		 428 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  28.51 
 
 		 701 aa  67  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  25 
 
 		 523 aa  67  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1087 aa  65.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  43.69 
 
 		 974 aa  63.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  29.41 
 
 		 366 aa  63.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  27.3 
 
 		 398 aa  62  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  29.07 
 
 		 647 aa  61.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  32.08 
 
 		 876 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  27.81 
 
 		 367 aa  61.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.19 
 
 		 687 aa  58.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  38 
 
 		 4978 aa  58.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  35.4 
 
 		 2816 aa  56.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  30.89 
 
 		 230 aa  57  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  30.75 
 
 		 2207 aa  55.5  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  39.45 
 
 		 1969 aa  55.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  37.32 
 
 		 2262 aa  55.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  40.82 
 
 		 1550 aa  55.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.62 
 
 		 761 aa  54.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  36.27 
 
 		 1781 aa  53.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.08 
 
 		 3816 aa  53.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  32.63 
 
 		 728 aa  52.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.53 
 
 		 2807 aa  52.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  26.74 
 
 		 254 aa  52.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  35 
 
 		 3474 aa  51.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.67 
 
 		 2114 aa  51.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1744 aa  50.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  33.61 
 
 		 972 aa  50.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.63 
 
 		 994 aa  49.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.3 
 
 		 369 aa  50.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  30.43 
 
 		 1269 aa  49.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1006 aa  48.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  28.38 
 
 		 1337 aa  48.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1752 aa  48.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  34.74 
 
 		 1132 aa  48.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  29.85 
 
 		 1597 aa  46.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  31.25 
 
 		 1269 aa  46.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1114 aa  45.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>