82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3146 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  73.29 
 
 		 1348 aa  1883    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 1337 aa  2684    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  45.54 
 
 		 1346 aa  1066    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  44.79 
 
 		 1437 aa  933    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  49.15 
 
 		 1433 aa  1050    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  38.5 
 
 		 752 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  36.32 
 
 		 749 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  36.87 
 
 		 1434 aa  172  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  32.04 
 
 		 702 aa  157  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  35.84 
 
 		 1827 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  33.89 
 
 		 621 aa  147  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  37.31 
 
 		 937 aa  147  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.53 
 
 		 11716 aa  145  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  35.32 
 
 		 640 aa  141  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.71 
 
 		 2507 aa  127  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  31.05 
 
 		 811 aa  110  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  30.21 
 
 		 885 aa  107  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  31.1 
 
 		 706 aa  106  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.16 
 
 		 1073 aa  94  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  29.11 
 
 		 500 aa  91.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  28.06 
 
 		 2064 aa  88.6  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  30.36 
 
 		 503 aa  86.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  29.71 
 
 		 466 aa  81.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  26.48 
 
 		 935 aa  79  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  31.02 
 
 		 819 aa  76.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.89 
 
 		 621 aa  67.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.13 
 
 		 959 aa  63.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 		 635 aa  62.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  24.12 
 
 		 406 aa  61.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  33.58 
 
 		 458 aa  61.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  24.82 
 
 		 1126 aa  59.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  27.9 
 
 		 404 aa  57.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.66 
 
 		 447 aa  56.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  26.32 
 
 		 1172 aa  56.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  27.1 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  27.95 
 
 		 2762 aa  54.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  29.12 
 
 		 1124 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  35.9 
 
 		 340 aa  53.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  37.33 
 
 		 243 aa  52  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  26.52 
 
 		 974 aa  52.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  28.41 
 
 		 491 aa  52  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  25 
 
 		 1166 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3105  hypothetical protein  34.62 
 
 		 787 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.667845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  36.11 
 
 		 755 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.88 
 
 		 1154 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1394 aa  50.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  24.91 
 
 		 1113 aa  49.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  28.38 
 
 		 1668 aa  48.9  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  27.94 
 
 		 485 aa  48.9  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  23.83 
 
 		 861 aa  48.5  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  27.36 
 
 		 3193 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1289 aa  48.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.89 
 
 		 1490 aa  48.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  27.8 
 
 		 510 aa  48.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.23 
 
 		 682 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.48 
 
 		 1118 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  24.94 
 
 		 2807 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  24.76 
 
 		 590 aa  47.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  25.7 
 
 		 1127 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  25.08 
 
 		 690 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.36 
 
 		 1340 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  33.33 
 
 		 465 aa  47.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.64 
 
 		 486 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  24.93 
 
 		 706 aa  47.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0895  FG-GAP repeat-containing protein  23.95 
 
 		 568 aa  47.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.06 
 
 		 1114 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1147 aa  47  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0445  FG-GAP repeat protein  38.04 
 
 		 964 aa  46.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.265676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3715  FG-GAP repeat-containing protein  24.2 
 
 		 514 aa  46.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  24.92 
 
 		 2497 aa  46.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4317  hypothetical protein  37.5 
 
 		 620 aa  46.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  35.06 
 
 		 371 aa  45.8  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  29.07 
 
 		 341 aa  45.8  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  29.33 
 
 		 550 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1684  FG-GAP repeat-containing protein  25.79 
 
 		 609 aa  45.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  24.75 
 
 		 435 aa  45.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  25.09 
 
 		 517 aa  45.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  26.58 
 
 		 524 aa  45.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  23.92 
 
 		 402 aa  45.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.08 
 
 		 1208 aa  45.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  32.88 
 
 		 693 aa  45.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.65 
 
 		 1113 aa  45.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>