80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1757 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  46.67 
 
 
1668 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  48.78 
 
 
646 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  43.55 
 
 
700 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  46.41 
 
 
495 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  41.88 
 
 
501 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  43.72 
 
 
1003 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  42.54 
 
 
336 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  43.18 
 
 
755 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  41.57 
 
 
1147 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  38.55 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  38.67 
 
 
340 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  41.1 
 
 
657 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  36.52 
 
 
1433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  39.89 
 
 
491 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  35.43 
 
 
1296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  39.41 
 
 
541 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  35.6 
 
 
571 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  35.52 
 
 
371 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  34.21 
 
 
333 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  35.38 
 
 
324 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  37.24 
 
 
1029 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  36.65 
 
 
1437 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  34.41 
 
 
477 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  37.11 
 
 
394 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  34.08 
 
 
757 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  37.71 
 
 
408 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  32.76 
 
 
736 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  29.63 
 
 
1174 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.15 
 
 
1773 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  32.06 
 
 
996 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  30.06 
 
 
1055 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.51 
 
 
1015 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  31.37 
 
 
1294 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  30.17 
 
 
571 aa  89.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  29.89 
 
 
634 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  50 
 
 
308 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  32.97 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  33.13 
 
 
558 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.62 
 
 
1783 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  30.99 
 
 
1215 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  36.91 
 
 
1575 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  29.1 
 
 
846 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  28.83 
 
 
933 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  31.52 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
686 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.34 
 
 
665 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.51 
 
 
1797 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  29.23 
 
 
803 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.99 
 
 
900 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  29.28 
 
 
688 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  29.28 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  26.7 
 
 
728 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.66 
 
 
570 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  29.19 
 
 
523 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  31.84 
 
 
601 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  27.33 
 
 
693 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  28.02 
 
 
366 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  27.91 
 
 
1318 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.82 
 
 
687 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  30.23 
 
 
647 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  27.07 
 
 
725 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  28.8 
 
 
398 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  26.97 
 
 
701 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  28.41 
 
 
428 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  25.79 
 
 
876 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  28.16 
 
 
1263 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  35.06 
 
 
1348 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  27.37 
 
 
1087 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  31.16 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  31.75 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  29.07 
 
 
1337 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  31.21 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5679  PKD domain containing protein  32.88 
 
 
511 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  31.31 
 
 
661 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  21.5 
 
 
1093 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  27.63 
 
 
243 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 
726 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1484  hypothetical protein  26.09 
 
 
937 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188972  normal  0.663437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>