132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2283 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 1296 aa  2629    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1055 aa  290  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  49.19 
 
 		 308 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1318 aa  269  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1263 aa  209  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  35.98 
 
 		 1215 aa  205  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  39.87 
 
 		 1294 aa  204  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  36.51 
 
 		 852 aa  199  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  32.42 
 
 		 799 aa  155  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  28.77 
 
 		 507 aa  148  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30.91 
 
 		 2192 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  30.14 
 
 		 743 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  41.95 
 
 		 501 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  40.61 
 
 		 1003 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  40.78 
 
 		 1433 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  38.07 
 
 		 408 aa  121  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  35.43 
 
 		 341 aa  121  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  39.34 
 
 		 755 aa  118  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  27.25 
 
 		 1332 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  42.11 
 
 		 362 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  37.93 
 
 		 495 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  34.57 
 
 		 646 aa  115  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  39.66 
 
 		 736 aa  112  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  39.57 
 
 		 333 aa  111  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  37.04 
 
 		 340 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  32.69 
 
 		 1092 aa  107  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  35.84 
 
 		 1029 aa  107  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  33.9 
 
 		 1437 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  36.08 
 
 		 757 aa  106  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  41.03 
 
 		 700 aa  106  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  35.71 
 
 		 394 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  38.71 
 
 		 1575 aa  105  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  45.3 
 
 		 1668 aa  105  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  36.97 
 
 		 1010 aa  104  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  36.25 
 
 		 371 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  32.16 
 
 		 657 aa  103  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  36.81 
 
 		 1147 aa  103  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  31.25 
 
 		 324 aa  101  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  32.06 
 
 		 350 aa  101  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  34.81 
 
 		 541 aa  101  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  32.56 
 
 		 933 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  38.37 
 
 		 477 aa  94.7  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  34.27 
 
 		 1174 aa  94.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 686 aa  94  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  33.95 
 
 		 491 aa  93.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  46.36 
 
 		 336 aa  93.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  24.39 
 
 		 1755 aa  90.9  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  26.17 
 
 		 1526 aa  90.9  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.58 
 
 		 1773 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  35.45 
 
 		 996 aa  90.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  29.79 
 
 		 417 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  33.92 
 
 		 543 aa  89  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.86 
 
 		 1783 aa  89.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  38.02 
 
 		 571 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  28.9 
 
 		 634 aa  85.1  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.71 
 
 		 1797 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1106 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.97 
 
 		 1015 aa  84  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  30.34 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  35.77 
 
 		 688 aa  81.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  26.73 
 
 		 775 aa  79.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.07 
 
 		 570 aa  79  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  31.49 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.72 
 
 		 900 aa  78.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  29.31 
 
 		 665 aa  78.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  37.86 
 
 		 376 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  32.42 
 
 		 441 aa  78.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  29.06 
 
 		 803 aa  78.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  32.19 
 
 		 846 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  32.8 
 
 		 701 aa  72.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  37.84 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  28.53 
 
 		 5453 aa  70.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  26.78 
 
 		 1170 aa  70.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.17 
 
 		 687 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  30.95 
 
 		 571 aa  69.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  34.75 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  28.91 
 
 		 464 aa  66.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  34.74 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  29.05 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.93 
 
 		 2031 aa  64.3  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  37.27 
 
 		 647 aa  63.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  31.11 
 
 		 230 aa  62.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  28.43 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  25 
 
 		 1216 aa  62  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  30.99 
 
 		 725 aa  62  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  26.7 
 
 		 728 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  26.77 
 
 		 483 aa  60.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  30.59 
 
 		 509 aa  60.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  35.2 
 
 		 601 aa  60.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  29.77 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  28.57 
 
 		 454 aa  57.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  30.63 
 
 		 476 aa  57.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  30.69 
 
 		 450 aa  57  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  30.89 
 
 		 876 aa  55.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  29.69 
 
 		 523 aa  54.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  42.31 
 
 		 459 aa  54.3  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  28.62 
 
 		 467 aa  55.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  28.99 
 
 		 693 aa  54.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1087 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>